高通量筛选(Highthroughputscreening,HTS)技术包括机器人技术、液体处理器、数据处理、相当多的软件和敏感的检测系统。它是一种药物发现过程,可以使生化或细胞事件能够重复和快速测试化合物数十万次。HTS可根据待测样品的种类大致分为细胞水平筛选和分子水平筛选两类。细胞水平筛选是在细胞个体水平上完成的检测,由于含有诸如信号传导、物质代谢等关于细胞生命活动的信息,因此可以省去体外筛选中的许多步骤。下面将围绕细胞水平筛选介绍几种常用的检测方法:离子通道检测、报告基因检测和细胞增殖检测。高通量筛选菌种是什么。浙江高通量筛选
然而传统的针对单一靶点的研究方法已经难以适应一些多基因疾病和病毒等相关药物的研究。而基于细胞水平的高内涵筛选(high content screening, HCS)技术实现了对化合物多靶点多参数的同时检测,从疾病相关基因调控通路和网络水平上研究药物的作用机制、代谢途径和潜在毒性等,也使在细胞水平评价活性化合物的成成为可能。从筛选载体上看,HCS和HTS并没有的区别,它的检测体积并未因检测指标增加而增高,操作步骤同样简单可行、可自动化。故HCS在新药研发中发挥越来越重要的作用。浙江高通量筛选高通量筛选技术原理。
蛋白质片段互补分析(PCA,也称为双分子荧光互补)和双杂交筛选允许检测细胞中蛋白质相互作用的形成/抑制。PCA将单个检测蛋白(荧光素酶、GFP、GAL)分成两部分,这些部分与感兴趣的蛋白质-蛋白质相互作用融合;如果伴侣结合,检测蛋白会重新形成并检测到信号。高内涵成像平台(HCS)由于其能够提供出色的单细胞分析功能和短的数据采集时间获得大家的青睐。一般的实验流程为设计实验并使用自动分液仪将细胞接种到96、384或1536孔板中;然后加入化合物,由于细胞在孵育过程中会对化合物做出反应,随后对细胞进行染色,并通过HCS成像系统获取图像,通过软件分析获取的图像以确定化合物的剂量反应。
正如之前提到,在高通量筛选中Assay的检出方法有很多,用于衡量酶活性多的当属于荧光检出法和吸光度检出法。这两种方法都能非常便捷的与高通量进行匹配。但是这两种检出方法也有不适用的场景,比如吸光度检出法,在终点法测定(endpointassay)时,如果化合物库的吸收低于~410nm,实验的背景吸收会引入假阳性(false-positive)和假阴性(false-negative)结果。虽然假阳性结果可以通过动力学Assay或者验证Assay来解决,但是由于微量定量板有位于340~410nm的强吸收,所以仍旧会导致Z因子降低,直接结果就是较弱活性的苗头化合物将很难被筛选出来。而对于荧光检出法而言,自发荧光化合物库或者具有光敏特性的化合物库同样会遇到假阳性和假阴性结果。在某种程度上,选择合适的检出方法可以减少甚至避免上述问题,比如使用更长波段的光源,对于荧光检出来说,>500nm会是比较好的选择。高通量筛选的检测技术。
微生物菌种的改造是现代微生物发酵行业中,提高其工业化生产性能,提高酶和菌的性能非常重要的一个环节。而快速高效的高通量筛选方法的建立又是菌株改造中非常重要的一个环节。传统的微生物快速筛选方法,琼脂平板法可分为表型活性筛选和表型生长选择。表型活性筛选利用菌落周围产生的水解圈、颜色圈或荧光产物等进行酶活或目标产物筛选;表型生长选择根据细胞对或其他有害物质的抗性或营养缺陷型互补,在选择培养基中依据生长情况进行筛选。琼脂平板筛选法基于透明圈、颜色圈的琼脂平板活性筛选或基于营养缺陷型或抗性的琼脂平板生长选择可作为简单易行的初筛方法,用于排除大量无活性和极低活性的突变体。但并不是所有的改造目标都能建立琼脂平板筛选法。琼脂平板筛选法,是一种简单直接的筛选方法,已用于多种水解酶(如脂肪酶、酯酶、蛋白酶)和氧化还原酶(如漆酶)等突变库的初步筛选中。高通量筛选催化剂技术。浙江高通量筛选
高通量筛选是什么技术。浙江高通量筛选
高通量筛选的实验方法分子水平和细胞水平的实验方法(或称筛选模型)是实现药物高通量筛选的技术基础。由于药物高通量筛选要求同时处理大量样品,实验体系必须微量化,而这些微量化的实验方法应根据新的科研成果来建立。第四军医大学周四元研究认为,药物高通量筛选模型的实验方法,根据其生物学特点,可分为以下几类:受体结合分析法;酶活性测定法;细胞分子测定法;细胞活性测定法;代谢物质测定法;基因产物测定法。这些实验方法,均已用于药物高通量筛选中。浙江高通量筛选