PCR反应的特异性决定因素为:①引物与模板DNA特异正确的结合;②碱基配对原则;③TaqDNA聚合酶合成反应的忠实性;④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性,使反应中模板与引物的结合(复性)可以在较高的温度下进行,结合的特异性明显增加,被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区,其特异性程度就更高。pcr实验失败的原因有哪些?江苏高效pcr原理PCR反应的特异性强,其决定因素为:①引物与模板DNA特异正确的结合;②碱基配对原则;③TaqD...
PCR是一种具有选择性的体外扩增DNA的片段的方法。其特异性由两个人工合成的引物DNA序列决定。所谓引物是指与待扩增核酸片段两端互补的寡核苷酸,其本质是ssDNA(单链DNA)的片段。指在引物指导下由酶催化的对特定模板(克隆或基因组DNA)的扩增反应,是模拟体内DNA复制过程,在体外特异性扩增基因片段的一种技术,在分子生物学中有普遍的应用,包括用于DNA作图、DNA测序、分子系统遗传学等。CR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,...
PCR实验技术中的快速PCR(FastPCR)介绍:在快速PCR中,通过缩减PCR步骤所需的时间来完成更快的扩增,而不影响扩增产量和效率。快速循环条件尤其适用于均有高扩增能力的DNA聚合酶,这种聚合酶在每次结合中可引入更多的核苷酸。高扩增能力的聚合酶可保持高扩增效率,而PCR延伸时间是Taq聚合酶(低扩增能力)延伸时间的1/2到1/3(图4)。通过将引物退火和延伸(如果温度只相差几度)合并成一步,PCR反应时间可进一步缩短。这个方案也被称为两步PCR方案。荧光定量PCR检测原理是什么?河北组织pcr哪家好PCR实验技术中的RT-PCR一步法和两步法的优缺点介绍:一步法:利用同一缓冲液,在同一体...
PCR实验过程一般分为三步:DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性比较好)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如图所示:现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是比较好也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度pcr检...
PCR实验技术中的RT-PCR介绍:在RT-PCR中,通过逆转录(RT)将RNA转化为cDNA,然后通过聚合酶链式反应(PCR)扩增cDNA(图1)。利用cDNA扩增步骤,有望对初始RNA进行进一步研究,即便RNA样本数量有限或低丰度表达。RT-PCR的常见应用包括表达基因检测、转录物变异检测,以及克隆和测序用cDNA模板制备。由于逆转录可为PCR扩增和下游实验提供cDNA模板,因此,它是实验成功的关键步骤之一。选定的逆转录酶应对所有样本均具有**高效率,即便是难转录RNA样本,如降解、抑制剂残留或具有高度二级结构的RNA样本。一步法和两步法是两种**常用的RT-PCR方法,每种方法都具有各自...
PCR实验技术中的反向PCR(InversePCR)介绍:反向PCR起初设计用于确定临近未知区域的序列。反向PCR有助于研究一个基因的启动子序列;致*染色体重排如基因融合、异位或转移;及病毒基因的整合。之所以称为反向PCR,是因为引物设计用于向两边延伸而不像常规PCR中朝着彼此延伸。如今,反向PCR常用于定点突变,复制一个具有预期突变的目的质粒。在研究基因组DNA未知序列的传统实验流程中,限制性内切酶消化和连接先于反向PCR,接着对PCR扩增子进行测序。对于gDNA消化,需选择一种限制性内切酶进行酶切以获得合适长度可自连的片段。同时,所选择的内切酶不应该切割已知序列,所以连接发生于侧翼的未知序...
PCR实验技术中的免疫-PCR(immuno-PCR)介绍:免疫-PCR(immuno-PCR)是新近建立的一种灵敏、特异的抗原检测系统。它利用抗原-抗体反应的特异性和PCR扩增反应的极高灵敏性来检测抗原,尤其适用于极微量抗原的检测。免疫-PCR试验的主要步骤有三个:①抗原-抗体反应,②与嵌合连接分子结合,③PCR扩增嵌合连接分子中的DNA(一般为质粒DNA)。该技术的关键环节是嵌合连接分子的制备。在免疫-PCR中,嵌合连接分子起着桥梁作用,它有两个结合位点,一个与抗原抗体复合物中的抗体结合,一个与质粒DNA结合,其基本原理与ELISA和免疫酶染色相似,不同之处在于其中的标记物不是酶而是质粒D...
长片段PCR通常指扩增大于5kb的DNA的片段。长片段PCR传统上使用TaqDNA聚合酶(为了快速延伸)和高保真酶(为了准确度)的混合物。随着高合成能力、高保真DNA聚合酶的发明,长片段PCR现在可在短时间内高准确性的完成。通过与一个强DNA结合蛋白的结合,聚合酶可获得高扩增能力,可在短时间内扩增长片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,极高保真度(如>100xTaq)可确保长片段扩增的低错误率。当扩增>10kb的片段时,PCR实验方案可能需要在以下5个关键位置进行适当优化:确保使用高质量、高纯度的DNA样本。如果DNA聚合酶的热稳定较低,使用更多量的DNA聚合酶以弥补多次循环中的聚合酶...
PCR实验技术中的巢氏PCR(NestedPCR)介绍:巢氏PCR需要两到三对引物,一般采用较为套引物扩增15-30个循环,再用扩增DNA的片段内设定的第二套引物扩增15-30个循环,这样可使待扩增序列得到高效扩增,而次级结构却很少扩增。套式引物PCR减少了引物非特异性退火,从而增加了特异性扩增,提高了扩增效率。若将套失PCR的内外引物稍加改变,延长外引物长度(25-30bp),同时缩短内引物长度(15-17bp),使外引物先在高退火温度下复性,做双温扩增,然后改换至三温循环,使内引物在外引物扩增的基础上,在低退火温度复性,直到扩增完成,这样就可以使两套引物一次同时加入。英瀚斯生物分子生物学平...
PCR实验过程一般分为三步:DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性比较好)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如图所示:现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是比较好也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度英瀚斯生...
PCR实验技术中的定量PCR介绍:由于序列扩增的产量依赖于模板DNA的量,所以PCR常用于对样品中DNA进行定量,常用的应用是基因表达的定量。终点法PCR是一种可能的方法,但其有较大的缺点,通过凝胶电泳来检测产量,检测的灵敏度非常有限。更重要的是,使用终点PCR是在PCR反应结束后进行定量,此时扩增已经达到平台期,DNA凝胶染色的强度与DNA起始量不成线性关系。尽管如此,通过终点法PCR可以对基因表达进行半定量,可以使用一系列稀释程度不同的DNA样本作为模板起始量,或者在特定的PCR循环处获取扩增产物,然后通过凝胶显色强度来估计基因的表达量。有没有做pcr检测比较快比较好的公司?山西推荐pcr...
pcr防止污染的方法(一)合理分隔实验室:将样品的处理、配制PCR反应液、PCR循环扩增及PCR产物的鉴定等步骤分区或分室进行。(二)吸样器:吸样器污染是一个值得注意的问题。由于操作时不慎将样品或模板核酸吸入器内或粘上器头是一个严重的污染源,因而加样或吸取模板核酸时要十分小心。(三)预混和分装PCR试剂:所有的PCR试剂都应小量分装,如有可能,PCR反应液应预先配制好,然后小量分装,-20℃保存。以减少重复加样次数,避免污染机会。另外,PCR试剂,PCR反应液应与样品及PCR产物分开保存,不应放于同一冰盒或同一冰箱。(四)防止操作人员污染,使用一次性手套、吸头、小离心管应一次性使用。(五)设立...
PCR实验技术中的定量PCR(QuantitativePCR)介绍:由于序列扩增的产量依赖于模板DNA的量,所以PCR常用于对样品中DNA进行定量,常用的应用是基因表达的定量。终点法PCR是一种可能的方法,但其有较大的缺点,通过凝胶电泳来检测产量,检测的灵敏度非常有限。更重要的是,使用终点PCR是在PCR反应结束后进行定量,此时扩增已经达到平台期(图11),DNA凝胶染色的强度与DNA起始量不成线性关系。尽管如此,通过终点法PCR可以对基因表达进行半定量,可以使用一系列稀释程度不同的DNA样本作为模板起始量,或者在特定的PCR循环处获取扩增产物,然后通过凝胶显色强度来估计基因的表达量。大鼠、小...
PCR样本可分2种,DNA样本和RNA样本。一,DNA样本:已经提取好的DNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,需全血,加入抗凝剂,抗凝管4度保存;组织样本,需冻存管或干净灭菌的离心管装,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。二,RNA样本:提取好的RNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,全血,加入抗凝剂,4度冰箱保存;组织样本,冻存管或干净灭菌离心管,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。长时间保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS组织和细胞沉淀用Trizol。什么是pcr的溶解曲...
PCR实验技术中的多重PCR(MultiplexPCR))介绍:多重PCR可实现在同一反应管中同时扩增多个不同的片段。多重PCR不仅意味着节约时间、试剂和样本,同时使得多个扩增子进行同时比较成为可能。当一个反应管中存在多个引物对时,如在多重PCR中,非特异性扩增和扩增效率的降低是较关注的问题,因为反应的优化不可能针对所有的引物对和片段。因此,引物的设计至关重要,以减少错配引起的非特异性扩增。引物序列对于目标片段应该是独特的,且所有引物的Tm值差异应在5℃内。在进行多重PCR前,每个引物对应在单个反应中验证其特异性和扩增效率。而且,不同大小的扩增子应在凝胶电泳中可区分开,以便鉴定。除了引物设计和...
原位PCR就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。原位PCR是Hasse等于1990年建立的,实验用的标本是新鲜组织、石蜡包埋组织、脱落细胞、血细胞等。其基本方法为:1、固定组织或细胞:将组织细胞固定于预先用四氟乙烯包被的玻片上,并用多聚甲醛处理,再灭活除去细胞内源性过氧化物酶。2、蛋白酶K消化处理:用60ug/ml的蛋白酶K将固定好的组织细胞片55℃消化处理2h后,96℃2min以灭活蛋白酶K。3、PCR扩增:在组织细胞片上,加PCR反应液,覆盖并加液体石蜡后,直接放在扩增仪的金...
PCR是一种具有选择性的体外扩增DNA的片段的方法。其特异性由两个人工合成的引物DNA序列决定。所谓引物是指与待扩增核酸片段两端互补的寡核苷酸,其本质是ssDNA(单链DNA)的片段。指在引物指导下由酶催化的对特定模板(克隆或基因组DNA)的扩增反应,是模拟体内DNA复制过程,在体外特异性扩增基因片段的一种技术,在分子生物学中有普遍的应用,包括用于DNA作图、DNA测序、分子系统遗传学等。CR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,...
PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板-引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,...
细胞长满80%瓶底或皿底,换培养液,第二天提取RNA(倒掉培养液,5-10ml冰PBS洗涤细胞2次空干)加1ml冰TRizoL,用力振荡培养瓶使细胞完全脱落,加样器吹打(吸入1.5ml离心管,旋涡振荡10秒,室温静置5分钟)加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡10秒,冰盒上静置10分钟(40C,8000rpm,5分钟,)吸取上层水相0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中,加异丙醇0.5-0.7ml(充分混匀,冰盒上静置10分钟,40C,12000rpm,15分)弃上清,加75%冰乙醇1ml,颠倒混匀数次(40C,12000rpm,15分)弃上清,沉淀快速风干。但不要完全干燥,加DEPC处理去...
PCR实验技术中的RT-PCR一步法和两步法的优缺点介绍:一步法:利用同一缓冲液,在同一体系中加入逆转录酶、引物、Taq酶、4种dNTP直接进行mRNA反转录与PCR扩增。发现Taq酶不仅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反转录酶活性,可利用其双重作用在同一体系中直接以mRNA为模板进行反转录和其后PCR扩增,从而使mRNA的PCR步骤更为简化。所需样品量减少到比较低限度,临床小样品的检测非常有利。用一步法扩增可检测出总RNA中小于1ng的低丰度mRNA.该法可用于低丰度mRNA的cDNA文库的构建及特异cDNA的克隆,并有可能与Taq酶的测序技术相组合,使得自动反转录、基因扩增与基因转录产物的...
PCR实验技术中的5’RACE-PCR介绍:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准一号链cDNA.利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到一号链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头(figure2)。然后用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物2(GSP2genespec...
PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DNA的片段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。PCR所用的酶主要有两种来源:Taq和Pfu,分别来自两种不同的噬热菌。其中Taq扩增效率高但易发生错配。Pfu扩增效率弱但有纠错功能。所以实际使用时根据需要必须做不同的选择。模板即扩增用的DNA,可以是任何来源,但有两个原则,1号纯度必须较高,第二浓度不能太高以免抑制。缓冲液的成分较为复杂,除水外一般包括四个有效成分:缓冲体系,一般使用HEPES或MOPS缓冲...
PCR是一种具有选择性的体外扩增DNA的片段的方法。其特异性由两个人工合成的引物DNA序列决定。所谓引物是指与待扩增核酸片段两端互补的寡核苷酸,其本质是ssDNA(单链DNA)的片段。指在引物指导下由酶催化的对特定模板(克隆或基因组DNA)的扩增反应,是模拟体内DNA复制过程,在体外特异性扩增基因片段的一种技术,在分子生物学中有普遍的应用,包括用于DNA作图、DNA测序、分子系统遗传学等。CR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,...
PCR的假阳性主要原因之一出现非特异性扩增带:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:必要时重新设计引物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸)。PCR的假阳性主要原因之一出现片状拖带...
PCR实验技术的发展历程,Khorana(1971)等**早提出核酸体外扩增的设想:“经DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可合成tRNA基因。”1983年4月的一个星期五晚上,他开车去乡下别墅的路上,猛然闪现出“多聚酶链式反应”的想法。1983年12月,Mullis用同位素标记法看到了10个循环后的49bp长度的***个PCR片段;1985年,KaryMullis在Cetus公司工作期间,发明了PCR。Mullis要合成DNA引物来进行测序工作,却常为没有足够多的模板DNA而烦恼。1985年10月25日申请了PCR的**,1987年7月28日批准(**号4...
PCR实验技术中的反向PCR介绍:反向PCR的目的在于扩增一段已知序列旁侧的DNA,也就是说这一反应体系不是在一对引物之间而是在引物外侧合成DNA.反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又称为染色体步移。这时选择的引物虽然与中心DNA两末端序列互补,但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程:扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接酶连接成一个环状分子,通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段。选择多种限制性内切酶,基本准则是选择不能在非酶切位点切断靶DNA的酶。裂解中心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游或下游区,而不裂...
PCR样本可分2种,DNA样本和RNA样本。一,DNA样本:已经提取好的DNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,需全血,加入抗凝剂,抗凝管4度保存;组织样本,需冻存管或干净灭菌的离心管装,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。二,RNA样本:提取好的RNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,全血,加入抗凝剂,4度冰箱保存;组织样本,冻存管或干净灭菌离心管,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。长时间保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS组织和细胞沉淀用Trizol。pcr检测实验成功的...
PCR实验技术中的锚定PCR(AnchoredPCR)介绍:锚定PCR主要用于分析具有可变末端的DNA序列,Loh等用A-PCR对人外周血淋巴细胞T细胞受体α-链的mRNA的多变性进行了分析。先合成cDNA,并用末端脱氧核苷酸转移酶在其3’-可变区末端加上一个PolyG尾巴。Loh等恒定区与可变区连接部位设一个引物,另一个引物是一个具5’-polyG尾巴的引物。带有PolyG尾巴的引物是一个固定点,它可以并与PolyG尾巴结合,无论其余部分序列如何,只识别片段末端,利用此法可从前述mRNA中检出至少20种不同序列,每一种都是独特的,表明A-PCR不对任何特殊序列有倾向性结果,可用于T细胞及其它...
PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成: 1、模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备。 2、模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。3、引物的延伸:DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链。重复循环变性--退火--延伸三...
PCR实验技术中的连接酶链反应(Ligasechainreaction,LCR)介绍:连接酶链反应(Ligasechainreaction,LCR),是一种新的DNA体外扩增和检测技术,主要用于点突变的研究及靶基因的扩增。连接酶链反应是Backman1997年为检出靶基因序列中的点突变而设计发明,并申报了**。1988年Landegren也进行了该项研究。1988年Backman等又因分离热稳定的连接酶,1991年Backman和Barany分别用耐热DNA连接酶进行了LCR试验。耐热DNA连接酶可以在热循环中保持活性,提高连接反应的特异性,排除了背景扩增和免除了不断补充酶的繁琐程序。pcr检...