PCR的假阳性主要原因之一出现非特异性扩增带:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:必要时重新设计引物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸)。PCR的假阳性主要原因之一出现片状拖带或涂抹带:PCR扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带。其原因往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起。其对策有:减少酶量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓度。增加模板量,减少循环次数。pcr检测有哪些操作步骤?海南pcr怎么选择
PCR实验技术中cDNA第二链的合成方法有以下几种:1、自身引导法合成的单链cDNA3'端能够形成一短的发夹结构,这就为第二链的合成提供了现成的引物,当***链合成反应产物的DNA:RNA杂交链变性后利用大肠杆菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反转录酶合成cDNA第二链,***用对单链特异性的S1核酸酶消化该环,即可进一步克隆。但自身引导合成法较难控制反应,而且用S1核酸酶切割发夹结构时无一例外地将导致对应于mRNA5'端序列出现缺失和重排,因而该方法目前很少使用。2、置换合成法该方法利用链在反转录酶作用下产生的cDNA:mRNA杂交链不用碱变性,而是在dNTP存在下,利用RNA酶H在杂交链的mRNA链上造成切口和缺口。从而产生一系列RNA引物,使之成为合成第二链的引物,在大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ的作用下合成第二链。该反应有3个主要优点:(1)非常有效;(2)直接利用链反应产物,无须进一步处理和纯化;(3)不必使用S1核酸酶来切割双链cDNA中的单链发夹环。广西组织pcr价格pcr实验失败的原因有哪些?
PCR实验技术中的MSP甲基化特异PCR介绍:一般调控区保持甲基化状态,基因不表达直接干扰转录因子和启动子识别位点的结合与转录抑制因子结合引起基因沉默改变染色质的结构MSP甲基化特异PCR是用对苯二酚和亚硫酸氢钠处理氢氧化钠变性的基因组DNA,使得未甲基化的C转化为T.按照C转换T后的基因序列设计出来的引物扩出目的基因。由于甲基化CpG岛中的C不能被转化为T,用以上的引物将不会扩出目的基因。通过上述手段就能达到识别基因组DNA甲基化与否的目的。
PCR实验技术中的多重PCR(MultiplexPCR))介绍:多重PCR可实现在同一反应管中同时扩增多个不同的片段。多重PCR不仅意味着节约时间、试剂和样本,同时使得多个扩增子进行同时比较成为可能。当一个反应管中存在多个引物对时,如在多重PCR中,非特异性扩增和扩增效率的降低是较关注的问题,因为反应的优化不可能针对所有的引物对和片段。因此,引物的设计至关重要,以减少错配引起的非特异性扩增。引物序列对于目标片段应该是独特的,且所有引物的Tm值差异应在5℃内。在进行多重PCR前,每个引物对应在单个反应中验证其特异性和扩增效率。而且,不同大小的扩增子应在凝胶电泳中可区分开,以便鉴定。除了引物设计和扩增子大小,热启动DNA聚合酶和特殊优化的PCR缓冲液对于多重PCR也是必需的,它们可有助于扩增的成功率和扩增的特异性。英瀚斯分子生物学检测平台,信得过的pcr检测。
PCR设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。⑤引物3'端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列比较好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以比较低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。英瀚斯生物pcr检测,保证真实实验检测,数据保密完整性。山东荧光定量pcr公司
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PCR实验技术中的直接PCR(DirectPCR)介绍:直接PCR意指直接从样本中扩增目的DNA,而无需核酸纯化。直接PCR中,在高温变性阶段,诸如细胞、组织等材料在独特的缓冲液中裂解,释放出DNA。因此这种方法简化了PCR实验流程,减少了动手操作的时间,同时可避免纯化步骤中DNA的损失。推荐具有高合成能力的DNA聚合酶用于直接PCR扩增。细胞碎片、蛋白、脂质和多糖也随DNA释放到裂解液中,它们会抑制PCR反应。具有高合成能力的DNA聚合酶可以耐受这些抑制剂,从而使直接PCR成为可能。具有高合成能力的聚合酶通常具有更高灵敏度,因此可从未纯化样本中扩增微量的DNA。海南pcr怎么选择
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