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北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

来源: 发布时间:2024年06月18日

GlycOCATCH用于纯化粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。它是基于无活性的Genovis的OpeRATOR®酶,该酶经过工程改造,可以高亲和力结合O-糖基化蛋白和肽。GlycOCATCH的应用包括O糖蛋白和肽的特异性富集或去除、糖组学、复杂样品的研究和生物制药的表征。1. 粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽的特异性富集;2. 可靠 - 高亲和力结合;3. 快速且易于使用的工作流程。不需要辅助因子或特殊缓冲液。GalNAcEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila,在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为52 kDa。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程; 4. 即用型 - 只需加水即可!用于水解糖蛋白上GalNAc残基的冻干酶。Genovis的GalNAcEXO冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在2000单位的小瓶中,用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc残基。OglyZOR 是一种内切糖苷酶用于确认O-糖的存在和降低样品的异质性。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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GlycOCATCH®亲和纯化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含:4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱,每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(总共 200 μg)。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 冻干 200 单位,用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 复杂样品的特异性净化;3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:O-连接聚糖参与多种生物过程,包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。青海高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究PNGase F 以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。

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Genovis的SialEXO产品是用于去除和分析唾液酸的唾液酸酶。这些酶对天然糖蛋白或游离的聚糖结构上存在的 N- 和 O-连接聚糖均具有活性。SialEXO用于在用OpeRATOR或OglyZOR消化之前预处理O-糖基化蛋白。其他应用包括降低样品复杂性、电荷异构体分析和外切糖苷酶阵列。N-连接、O-连接和游离聚糖的高效去唾液酸化快速去除唾液酸,增强对蛋白质电荷变体的分析可固定在即用型离心柱中。然后可以用FabRICATOR消化所得的去糖基化蛋白,并通过中级质谱分析。我们将该工作流程应用于依那西普的分析,虽然未经处理的TNFR结构域过于复杂而无法分析,但O-聚糖组成可以在用PNGase F处理后进行分离和比较。

我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 (EPO) 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质,其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。SialEXO固定化酶含有与琼脂糖珠共价偶联的SialEXO酶,用于糖蛋白的去唾液酸化,而不会被酶污染z终制剂。

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在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后,在质谱图中观察到几个与GalNAcs相关的峰。为了去除剩余的GalNAc残基,应用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO处理后观察到的单个蛋白峰显示完全去除剩余的GalNAcs。 GalNAcEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性,使其与大多数样品相容。此外,GalNAcEXO的活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子,如BSA。根据底物的性质,糖蛋白的GalNAcEXO反应在2小时内完成,而更复杂的样品可能需要孵育过夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在离心柱中,以便快速方便地处理样品,在制备过程中不会残留酶。人血清中 O-糖蛋白的富集:GlycOCATCH还可用于从复杂的样品混合物(如人血清)中选择性富集O-糖基化蛋白。广东高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物,可快速有效地去除抗体;北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

G0F 抗体在 30 分钟内:半乳糖的存在会影响zhiliao性抗体引发的效应功能,为了研究抗体的作用方式,可能需要彻底去除半乳糖残留物。Genovis的GalactEXO Immobilized 的 β1-4 半乳糖苷酶活性在曲妥珠单抗上使用 30 分钟孵育证明。genovis的GalactEXO Immobilized 由强大的 GalactEXO 酶组成,该酶固定在琼脂糖珠上,并以易于使用的微离心柱形式格式化。GalactEXO是β-半乳糖苷酶的混合物,可有效去除N-和O-糖基化蛋白上的半乳糖残基。使用FabRICATOR®将抗体消化成亚基,并使用LC-MS进行分析。使用 GalactEXO 冻干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的转变,但后者在z终制剂中没有留下酶。没有任何半乳糖基化结构表明半乳糖残基完全水解,因此LC-MS数据中任何剩余的次要峰都可以注释为亚基的糖化。没有任何半乳糖基化结构表明半乳糖残基完全水解,因此LC-MS数据中任何剩余的次要峰都可以注释为亚基的糖化。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究