当在完整状态下进行分析时,EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖,因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议(在37°C下进行O/N孵育),两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理,并显示数据以供比较。另一方面,N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态,就根本无法接近。因此,这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。人血清中 O-糖蛋白的富集:GlycOCATCH还可用于从复杂的样品混合物(如人血清)中选择性富集O-糖基化蛋白。甘肃用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
Genovis的SialEXO固定化用于复杂糖蛋白的去唾液酸化:在设置反应条件时,需要在所需的反应时间和完成反应所需的酶量之间进行权衡。较高的酶量可保证在更短的时间内完成周转,但会使下游分析复杂化。为了避免此类问题,我们以离心柱形式固定了活性SialEXO。这允许以更短的孵育时间孵育具有明显更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。这种糖蛋白是一种具有挑战性的底物,具有 6 个 N- 和多达 26 个 O-聚糖,由 α2,3 和 α2,6 连接的唾液酸修饰。对游离的N-聚糖的分析表明,SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化,SialEXO固定化。广东冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究亲和纯化微离心柱,SialEXO 冻干 200 单位,OpeRATOR 冻干 200 单位。
GlycOCATCH®亲和纯化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含:4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱,每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(总共 200 μg)。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 冻干 200 单位,用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 复杂样品的特异性净化;3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:O-连接聚糖参与多种生物过程,包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。
GlycOCATCH设计用于特异性结合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。亲和树脂基于无活性的Genovis的OpeRATOR酶,该酶经过工程设计,可以高亲和力结合O-糖基化蛋白和肽。 结合在pH 5-8的生理缓冲液中进行。由于GlycOCATCH树脂和O-糖蛋白/肽之间的强相互作用,可以用8M尿素进行洗脱。或者,可以使用活性OpeRATOR酶进行洗脱,该酶消化O-聚糖位点的N末端结合的O-糖蛋白。在后一种情况下,肽在天然条件下回收。OpeRATOR 冻干酶包含在购买中。由于 O-糖蛋白上的旋亚氨酸化 O-聚糖与树脂结合效率更高,因此唾液酸酶混合物 SialEXO 冻干也包含在购买中。两种酶都含有 His 标签,酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。
Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖:依那西普是一种融合蛋白,由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇,使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性,制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品:(i)携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白,(ii)用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构,以及(iii)用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基, 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品(图1)。作为比较,SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中,以将Fc区与大多数C端糖肽分离,以促进其表征。O-糖基化生物制药(如依那西普)表征:PNGase F、OglyZOR。辽宁PNGaseF去糖基化酶
用SialEXO处理血清,上样于GlycOCATCH,洗涤,洗脱O-糖基化蛋白。Swiss Prot 数据库鉴定蛋白质列表。甘肃用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效;与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进基础蛋白的分析;固定形式可提高酶与底物的比率,从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州,美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。甘肃用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发