PCR实验室设计的中心问题是如何避免污染。在实际工作中,常见的有以下几种污染类型:扩增产物的污染;天然基因组DNA的污染;试剂的污染以及标本间的污染。由于一旦发生污染,实验就必须停止,直到找到污染源为止,而且实验结果必须作废,需重新进行实验。所以发生污染后再围绕实验室来寻找污染源不但耗时而且繁琐,浪费人力物力。因此要避免污染,首先应是预防,而不是排除。PCR扩增检验实验室原则上分为四个单独的工作区域:试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区、扩增产物分析区。为避免交叉污染,进入各个工作区域必须严格遵循单一方向进行,即只能从试剂贮存和准备区→标本制备区→扩增反应混合物配制和扩增区→扩增产物分析区。 各实验区之间的试剂及样品传递应通过传递窗进行。英瀚斯生物,分子平台实验人员十年以上经验,专业pcr检测。湖南细胞pcr多少钱
PCR实验技术中的Touch-downPCR介绍:Touch-downPCR又称降落PCR.即选定一个温度范围,如50—35℃,每降1-2℃进行1-2个循环,然后在50度下进行15个循环。Touch-down的原理随着退火温度的降低,特异性逐步降低,但特异性条带在温度较高时已经扩增出来,其浓度远远超过非特异性条带,随着退火温度的降低,特异性条带优先被扩增。选择初始复性温度的原则起始复性温度应该比引物的Tm值高出5-10度,然后每个循环递减1-2度Touch-downPCR的应用范围lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;河南样本pcr实验室英瀚斯分子生物学检测平台,信得过的pcr检测。
PCR出现假阳性的原因分析。引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:①操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样器内或溅出离心管外。②除了酶及其他不耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管均应一次性使用。③必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。
PCR实验技术中的反向PCR介绍:反向PCR的目的在于扩增一段已知序列旁侧的DNA,也就是说这一反应体系不是在一对引物之间而是在引物外侧合成DNA.反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又称为染色体步移。这时选择的引物虽然与中心DNA两末端序列互补,但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程:扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接酶连接成一个环状分子,通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段。选择多种限制性内切酶,基本准则是选择不能在非酶切位点切断靶DNA的酶。裂解中心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游或下游区,而不裂解中心区的酶则使两侧序列都扩增Southern杂交来确定内切酶用以产生大小适于环化及反向PCR的片段的末端片段大多数有核基因组含有大量中度和高度重复序列,所以往往需要两组到三组嵌套引物英瀚斯生物,专业分子检测平台,高质量pcr检测。
PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DNA的片段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。PCR所用的酶主要有两种来源:Taq和Pfu,分别来自两种不同的噬热菌。其中Taq扩增效率高但易发生错配。Pfu扩增效率弱但有纠错功能。所以实际使用时根据需要必须做不同的选择。模板即扩增用的DNA,可以是任何来源,但有两个原则,1号纯度必须较高,第二浓度不能太高以免抑制。缓冲液的成分较为复杂,除水外一般包括四个有效成分:缓冲体系,一般使用HEPES或MOPS缓冲体系;一价阳离子,一般采用钾离子,但在特殊情况下也可使用铵根离子;二价阳离子,即镁离子,根据反应体系确定,除特殊情况外不需调整;辅助成分,常见的有DMSO、甘油等,主要用来保持酶的活性和帮助DNA解除缠绕结构。大鼠、小鼠血清做pcr检测哪家好?湖南细胞pcr多少钱
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PCR实验技术中的巢氏PCR(NestedPCR)介绍:巢氏PCR需要两到三对引物,一般采用较为套引物扩增15-30个循环,再用扩增DNA的片段内设定的第二套引物扩增15-30个循环,这样可使待扩增序列得到高效扩增,而次级结构却很少扩增。套式引物PCR减少了引物非特异性退火,从而增加了特异性扩增,提高了扩增效率。若将套失PCR的内外引物稍加改变,延长外引物长度(25-30bp),同时缩短内引物长度(15-17bp),使外引物先在高退火温度下复性,做双温扩增,然后改换至三温循环,使内引物在外引物扩增的基础上,在低退火温度复性,直到扩增完成,这样就可以使两套引物一次同时加入。湖南细胞pcr多少钱
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