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细胞增殖分析是细胞生长和分化研究的关键，在药物开发阶段常用来评估化学药物的毒性和对细胞生长的控制作用。通常根据平均DNA含量或细胞代谢参数进行细胞增殖检测，此类分析可以报告出总细胞数目和活细胞数目，或者测定出单个细胞内的DNA合成情况。细胞增殖染料稀释分析主要基于细胞膜通透性，荧光团分子、染料进入细胞后，将会共价结合到蛋白质上的氨基基团上，从而使染料能够长时间停留在细胞中。经过之后的细胞分裂阶段，各个子代细胞会从母细胞中接收到大约一半的荧光染料。采用流式细胞仪对荧光强度进行分析，即可测定出自标记结合起，单个细胞或细胞群所经历的传代数目。

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