CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
在比较BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶对于复杂DNA片段扩增的适用性时,以下是一些关键点:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高热稳定性和扩增效率而被应用于常规PCR。它扩增速度为30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,无校正功能,易产生错配碱基。-对于结构复杂的模板,如GC含量高、有二级结构等,TaqPlus可以用于扩增,能有效地扩增10kb以下的片段。-有产品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通过基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具备更强大的扩增性能,适合扩增高度复杂的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高适温度,能够适应更加苛刻的扩增条件,同时消除DNA二级结构,因而能够准确并且均匀地扩增全基因组序列。-BstDNA聚合酶大片段能够优先扩增短片段的DNA,并且能够确保扩增得到的DNA覆盖了整个基因组,连贯并且无偏地扩增所有的遗传位点。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,扩增速度高达10秒/kb,扩增目的片段长达13kb,具有极强的扩增效率的模板适应性,非常适合复杂模板的高保真扩增。
ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端处理上的主要不同点如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脱氧核糖核酸酶活性,它从DNA链的3'-OH末端逐步切去单核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**底物特异性**:-**ExoIII**:适底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于双链DNA切刻位点产生单链缺口。由于对单链DNA无活性,因此难以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:适底物是5'磷酸化的双链DNA,对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**活性差异**:-**ExoIII**:对具有3'-突出末端(至少有4个碱基,且具有3'-末端C残基)的DNA、单链DNA、硫代磷酸酯连接的核苷酸无活性。-**Lambda核酸外切酶**:对5'-OH端的切割速度比5'-P端慢约20倍;对单链DNA的酶切速度比双链DNA慢约100倍。4.**应用场景**:-**ExoIII**:可以用于生产特定方向的单链DNA,将线性化DNA设计成为一端为不切割末端(3'突出端),另一端则设计为易切割末端(平端或5'突出端)。
pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下实验中特别有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:这是一种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,pA-MNase在此技术中用于在免疫沉淀后切割染色质DNA,以分析特定蛋白质与DNA的结合位点。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:这是一种蛋白质-基因组互作研究技术,pA-MNase在此技术中用于在目标蛋白质被抗体识别后,通过核酸酶活性切割附近的DNA,从而释放与目标蛋白质相互作用的DNA片段。CUT&RUN技术相比传统的ChIP-Seq具有实验周期短、信噪比高、可重复性好以及细胞投入量低的优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、**以及表观遗传学等研究领域。3.**染色质免疫沉淀实验**:pA-MNase在染色质免疫沉淀实验中用于染色质片段化,它在核小体间DNAlinker上进行切割保持了核小体的完整性,并且由于其温和的酶解条件,消除了超声功率的可变性和超声过程中染色质乳化所带来的负面影响。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除细胞裂解液中的核酸,以减少样品的粘度,这对于后续的蛋白质分析实验尤为重要。
嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)是一种热稳定的酶,它在高温下(55-65°C)仍然保持活性,这使得它在分子生物学实验中非常有用,尤其是在需要高温反应的实验中,如热循环扩增(PCR)。BstDNAPolymeraseI具有以下特性:1.**热稳定性**:BstDNAPolymeraseI在高温下具有较高的稳定性,适用于高温反应的实验,如PCR。2.**3'到5'外切酶活性**:这种酶具有3'到5'外切酶活性,能够切除DNA末端上的非特异性引物和杂交DNA,使其成为等温扩增应用的理想酶。3.**耐盐性**:BstDNAPolymeraseI在高盐条件下仍能保持稳定活性,这在一些特殊的PCR应用中非常有用。4.**等温扩增**:由于其3'到5'外切酶活性,BstDNAPolymeraseI用于等温扩增反应,如LAMP技术,这种技术能够在恒温下进行DNA扩增,无需繁琐的温度循环。5.**快速PCR**:由于其高温稳定性,BstDNAPolymeraseI也可用于快速PCR反应,缩短了实验时间。6.**高GC含量模板扩增**:BstDNAPolymeraseI对高GC含量模板的扩增效果较好,因此在一些难扩增的模板中表现出色。Pfu DNA Polymerase 适合扩增较长的DNA片段,有助于在基因编辑中处理大的基因区域或复杂的基因结构。Recombinant Biotinylated Human TSLP Protein,His-Avi Tag
在某些糖蛋白的纯化方案中,利用 Endo H 对糖链的特异性水解作用,去除糖蛋白上的糖链。Recombinant Human TrkAProtein,His Tag
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶大片段)是一种常用于分子生物学实验的酶,特别是在等温DNA扩增技术中。以下是一些关于BstDNAPolymerase,LargeFragment的关键信息:1.**来源**:这种酶来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillusstearothermophilus),是一种热稳定的DNA聚合酶。2.**活性**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有5'到3'的DNA聚合酶活性,并且具有链置换活性,这使得它能够用于等温扩增反应,如环介导等温扩增(LAMP)。3.**热稳定性**:由于其嗜热特性,BstDNAPolymerase,LargeFragment能够在较高的温度下保持活性,通常在60-65°C。4.**应用**:-**等温扩增**:用于LAMP和其他等温扩增技术,这些技术不需要传统的热循环仪。-**全基因组扩增**:用于快速扩增少量DNA样本,以进行进一步的分析。-**突变检测**:在某些情况下,用于检测特定基因的突变。5.**优点**:-**高保真度**:与某些其他DNA聚合酶相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment具有较高的保真度。-**快速扩增**:等温扩增技术可以在短时间内快速产生大量DNA。Recombinant Human TrkAProtein,His Tag
T7 RNA聚合酶(高浓度)
Recombinant Mouse ECSCR Protein
Recombinant Human HMGB1(His Tag)
Biotinylated Recombinant Human 4-1BB/TNFRSF9 (His-Avi Tag)
Recombinant Human Kallikrein 3/PSAProtein
Recombinant Human CD58 Protein
Recombinant Human/Mouse/Rat Activin A Protein
Recombinant Mouse Glypican 1/GPC1 Protein
Recombinant Mouse TREM2 Protein
NP(118-126)