磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒在科研中的应用非常广,主要包括以下几个方面:1.**PCR产物的纯化**:磁珠法试剂盒可以从PCR反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等杂质,回收率高,产物纯度好,可以直接应用于PCR、连接、测序、NGS建库等下游实验。2.**基因组DNA的提取**:适用于从血液、唾液、口腔拭子和动物组织等样品中分离纯化高质量基因组DNA,提取的DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠,适合高通量工作站的自动化提取。3.**质粒DNA的提取**:磁珠用于从粗制的提取物中分离质粒DNA,通过精心优化的溶液将质粒DNA从基因组DNA和蛋白质中分离出来。4.**DNA片段的分离**:有许多类型的DNA分离试剂盒可供选择,包括DNA片段的分离。DNA片段可能需要为下一代测序协议进行分离,在这种情况下,可以用能选择分子大小的磁珠来分离片段。5.**自动化和高通量操作**:磁珠法试剂盒适合手工操作,也可用于自动化工作站或核酸自动提取仪,实现高通量操作。6.**分子生物学研究**:磁珠法试剂盒在基因组研究、分子进化研究等领域有广泛应用,为遗传病研究、筛查等提供了强有力的技术支持。其作用位点相对局限,主要作用于高甘露糖型和部分杂合型 N - 连接糖链,对于复杂型 N - 连接糖链的作用较弱。Recombinant Mouse CEACAM-1/CD66a Protein,His Tag
牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在实验室中的使用主要涉及以下几个步骤:1.**DNA载体连接**:-牛痘DNA拓扑异构酶I可以用于DNA载体连接,特别是在TOPO克隆载体制备中。它能够识别并切割双链DNA末端[5’C(T)CCTT],并与DNA形成共价连接形成稳定复合物,遇到DNA的5’-OH基团后,重新连接形成完整DNA链。2.**接头连接**:-在NGS建库中,牛痘DNA拓扑异构酶I可用于接头连接。这包括将含有特定序列的接头A和接头B与酶一起孵育,以实现DNA片段的连接。3.**操作步骤**:-**质粒解旋**:将超螺旋质粒DNA与牛痘DNA拓扑异构酶I混合,在37°C下孵育5-15分钟,以实现质粒的解旋。-**接头连接**:将接头A(含CCCTT序列)和接头B(含5’OH)与牛痘DNA拓扑异构酶I混合,在37°C下孵育5-15分钟,以实现接头的连接。4.**注意事项**:-双链接头A通常5’端做NH2封闭修饰,以防止自连接;接头A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再长的尾巴会导致连接效率大幅下降。-双链接头B的5’端必须包含-OH。-由于该酶应用广,在不同的实验中使用策略不同,需要灵活运用,并根据具体文献进行调整。
Recombinant Biotinylated Human B7-1/CD80 Protein,His-Avi TagUDG在结构上属于单功能DNA糖基化酶,它通过沿着DNA链滑动,识别尿嘧啶分子,进行碱基切除。
在DNA提取过程中避免RNA污染的关键在于采取一系列措施来确保RNA被有效去除或降解,同时保护DNA的完整性和纯度。以下是一些确保DNA提取过程中避免RNA污染的策略:1.**使用专门的DNA提取试剂盒**:选择高质量的DNA提取试剂盒,这些试剂盒通常已经包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和纯化步骤,能够有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)处理**:在DNA提取过程中加入RNase处理步骤,可以有效地去除残留的RNA污染。RNase是一种能够特异性降解RNA的酶,可以在不影响DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**优化实验操作步骤**:在破碎细胞时,选择合适的破碎方法和破碎时间,避免过度破碎导致RNA的释放;在DNA纯化阶段,控制好离心速度和时间,避免RNA的沉淀。4.**使用无RNase的试剂和耗材**:使用经过RNase-free处理的实验器材和试剂,确保实验过程中不会引入外源性RNA污染。5.**严格控制实验环境**:保持实验室台面和工作区域干净无尘,定期对实验室进行消杀,避免RNA酶污染。6.**个人防护和操作规范**:在处理DNA样品时,佩戴无菌手套和口罩,以减少呼吸道和皮肤污染的风险。使用不同的工具处理不同的样品,或者在处理前后彻底清洗工具,避免交叉污染。
ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端处理上的主要不同点如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脱氧核糖核酸酶活性,它从DNA链的3'-OH末端逐步切去单核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**底物特异性**:-**ExoIII**:适底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于双链DNA切刻位点产生单链缺口。由于对单链DNA无活性,因此难以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:适底物是5'磷酸化的双链DNA,对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**活性差异**:-**ExoIII**:对具有3'-突出末端(至少有4个碱基,且具有3'-末端C残基)的DNA、单链DNA、硫代磷酸酯连接的核苷酸无活性。-**Lambda核酸外切酶**:对5'-OH端的切割速度比5'-P端慢约20倍;对单链DNA的酶切速度比双链DNA慢约100倍。4.**应用场景**:-**ExoIII**:可以用于生产特定方向的单链DNA,将线性化DNA设计成为一端为不切割末端(3'突出端),另一端则设计为易切割末端(平端或5'突出端)。
CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
尽管Ultra-Long Master Mix设计用于长片段扩增,但在某些情况下,可能出现非特异性扩增,需要通过优化引物。Recombinant Mouse CEACAM-1/CD66a Protein,His Tag
提取的DNA质量评估通常涉及以下几个方面:1.**纯度评估**:-**分光光度法**:通过测量DNA样本在260nm和280nm处的吸光度(OD值)来评估DNA的纯度。纯度可以通过OD260/OD280的比值来评估,对于纯DNA,这个比值通常在1.8左右。如果比值低于1.8,可能表明存在蛋白质污染;如果高于1.9,则可能存在RNA污染。此外,OD260/OD230的比值可以用来评估盐离子等杂质的残留,纯DNA的比值应在2.0-2.2之间。-**琼脂糖凝胶电泳法**:通过电泳分离DNA片段,根据DNA在凝胶上的迁移情况来评估其纯度。如果泳道口中存在较亮的条带,可能表明存在蛋白污染。2.**浓度评估**:-**紫外分光光度计**:使用紫外分光光度计测定DNA在260nm处的吸光度,根据比尔-朗伯定律(Beer-Lambertlaw)计算DNA的浓度。对于纯DNA,OD260的读数为1.0时,大约相当于50μg/mL的双链DNA。-**荧光定量法**:使用荧光染料结合DNA,通过测量荧光变化来定量DNA。这种方法比紫外分光光度法更敏感、精确,并且可能对特定的核酸有特异性。
T7 RNA聚合酶(高浓度)
Recombinant Mouse ECSCR Protein
Recombinant Human HMGB1(His Tag)
Biotinylated Recombinant Human 4-1BB/TNFRSF9 (His-Avi Tag)
Recombinant Human Kallikrein 3/PSAProtein
Recombinant Human CD58 Protein
Recombinant Human/Mouse/Rat Activin A Protein
Recombinant Mouse Glypican 1/GPC1 Protein
Recombinant Mouse TREM2 Protein
NP(118-126)