EndoS酶在抗体药物偶联物(ADCs)研究中的具体应用主要体现在糖链定点偶联技术方面。根据上海药物研究所的研究进展,EndoS酶被用于实现定点ADC化合物的“一步”制备,这是一种新颖的糖链定点ADC制备策略。该策略利用了新颖截短型糖结构的药物-连接子和野生型糖苷内切酶EndoS2,将小分子细胞毒药物直接定点连接到抗体糖基化位点,从而克服了传统糖链定点ADC制备策略的限制。具体来说,研究人员通过筛选发现,EndoS2酶可以将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点,并且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响EndoS2的转糖基化活性。这一发现使得EndoS2和LacNAc的组合可以直接实现野生型抗体的糖基化改造,且EndoS2对多样化LacNAc修饰的兼容性,可以高效获得多样性功能修饰的岩藻糖化或去岩藻糖化的糖工程抗体。此外,研究人员还利用叠氮化修饰的LacNAc底物实现了抗体糖基化位点的“一步”叠氮化修饰,并通过点击化学反应偶联药物-连接子,实现了“两步”制备得到定点ADC化合物。
SpCas9蛋白(来自化脓性链球菌的Cas9蛋白)在基因编辑中的主要作用是作为核酸酶,能够精确地切割目标DNA序列。以下是SpCas9在基因编辑中的几个关键步骤和作用:1.**识别和结合**:SpCas9蛋白与一个单导向RNA(sgRNA)结合,形成RNP复合物。这个复合物能够识别并结合到基因组中与sgRNA互补的特定DNA序列。2.**PAM序列识别**:SpCas9需要一个称为原间隔子相邻基序(PAM)的特定序列作为识别目标DNA的先决条件。对于SpCas9,这个PAM序列通常是5'-NGG-3'。3.**DNA切割**:一旦RNP复合物与目标DNA结合,SpCas9就会在PAM序列的3个碱基对的上游位置切割DNA双链,产生一个双链断裂(DSB)。4.**引发DNA修复**:DNA双链断裂触发细胞的DNA修复机制,包括同源定向修复(HDR)和非同源末端连接(NHEJ)。研究人员可以利用这些修复机制来插入、删除或替换特定的DNA序列。5.**基因修改**:通过HDR,可以在断裂的DNA两端引入特定的DNA模板,从而实现精确的基因编辑。而NHEJ通常会导致小的插入或缺失(indel),这可以用来产生基因的敲除或敲入。6.**提高编辑效率**:为了提高SpCas9的编辑效率,研究人员可能会使用优化的sgRNA设计、蛋白质工程或嵌合融合蛋白等策略。
NLS-Cas9Nuclease是一种重组的化脓性链球菌Cas9蛋白,它在N端和C端都添加了核定位信号(NLS),这使得它能够更有效地进入细胞核并进行基因组编辑。这种蛋白与CRISPR/Cas9系统的引导RNA(gRNA)形成稳定的核糖核的蛋白(RNP)复合物,可以在进入细胞后立即定位到细胞核,从而诱导特定的DNA双链断裂,实现基因编辑。与传统的mRNA或质粒系统相比,使用NLS-Cas9Nuclease不需要转录和翻译过程,因此可以避免将外源DNA插入基因组的风险,这对于基因编辑尤其有用。NLS-Cas9Nuclease的特点包括:1.无DNA:系统不添加外部DNA,降低了插入外源DNA的风险。2.高切割效率:双NLS确保Cas9蛋白高效进入细胞核。3.低脱靶效应:Cas9核酸酶的瞬时表达提高了切割的特异性。4.节省时间:无需转录和翻译过程。这种核酸酶可以用于体外DNA切割筛选高效和特异性靶向gRNA,以及通过电穿孔或注射与特定gRNA结合时的体内基因编辑。产品的保存条件通常是在-25~-15℃,有效期为一年。使用时,可以根据推荐的反应体系进行体外DNA裂解实验,并通过琼脂糖凝胶电泳检测消化效率。具体产品的详细信息和应用指南,可以参考金斯瑞生物科技有限公司、NEB、金斯瑞、YEASEN和Novoprotein等公司提供的资料。
磁珠法提取的DNA通常指的是通过磁珠吸附技术从样本中纯化得到的核酸,而基因组DNA(gDNA)是指一个生物体细胞核中包含的全套遗传信息的DNA。两者的主要区别在于:1.**来源和组成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因组DNA,也可以是质粒DNA、线粒体DNA等其他类型的DNA。它是一个广的概念,指的是通过磁珠法技术提取的任何类型的DNA。-基因组DNA特指一个生物体细胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非编码区域。它通常包含了大量的碱基对,如人类基因组由大约30亿个碱基对组成。2.**纯度和应用**:-磁珠法提取的DNA的纯度和质量取决于提取过程中的裂解、吸附、洗涤和洗脱步骤,以及磁珠的质量和操作条件。高质量的磁珠法提取的DNA可以用于多种分子生物学实验,如PCR、克隆、测序等。-基因组DNA的提取通常需要考虑其完整性和纯度,以确保后续实验的准确性。基因组DNA提取的难点在于血液样本成分复杂,且白细胞体积占比低,因此提取纯化难度较高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一种高效、快速的核酸提取技术,它利用磁珠表面修饰的特定官能团与核酸的特异性结合,通过外加磁场实现核酸与杂质的快速分离。去泛素化酶(Deubiquitinating enzymes, DUBs)可以去除泛素化蛋白上的泛素链,使泛素分子得以回收和再利用。
在进行IdeSProtease的分子改造时,平衡酶的活性和稳定性是一个关键的挑战。以下是一些策略,这些策略可以帮助研究者在提高酶稳定性的同时保持或甚至提高其催化活性:1.**定向进化**:使用定向进化技术进行多轮的突变和筛选,以获得在所需条件下具有改进稳定性的酶变体,同时监测其催化活性,确保改造后的酶保持高效催化能力。2.**结构基础的理性设计**:基于IdeSProtease的三维结构信息,识别可能影响稳定性和活性的关键氨基酸残基,通过点突变或小肽插入来优化这些区域。3.**计算模拟**:利用分子动力学模拟和计算化学方法预测突变对酶稳定性和活性的影响,以指导理性设计。4.**糖基化修饰**:通过糖基化可以增加酶的溶解性和稳定性,但需注意不要干扰酶的活性位点或底物结合位点。5.**活性位点附近的柔性区域改造**:通过刚化柔性区域的策略提高酶的热稳定性,同时保持活性位点的柔性以维持催化活性。6.**长距离相互作用分析**:研究蛋白质内部的长距离相互作用,识别影响稳定性和活性的远程突变,通过这些突变优化酶的性能。7.**酶活性和稳定性的权衡分析**:通过实验数据,分析酶活性和稳定性之间的关系,找到比较好平衡点。FnCas12a系统的脱靶效应较低,这对于减少非目标效应和提高物质的安全性至关重要。Recombinant Mouse PDGF-BB
泛素分子可以通过其内部的赖氨酸残基与其他泛素分子形成多聚泛素链,这一步骤通常由E3酶催化。Recombinant Cynomolgus PCSK9 Protein,His Tag
酵母重组表达的N-糖苷酶F(PNGaseF)是一种酰胺水解酶,具有以下特点:1.**高效性**:PNGaseF是去除几乎所有N-连接寡糖从糖蛋白中有效的酶法方法。它能够在几分钟内快速且无偏倚地释放所有的N-糖链,适合后续的色谱或质谱分析。2.**重组酶**:该酶是重组的酰胺酶,能够从高甘露糖、杂合和复杂寡糖中切割内GlcNAc和天冬氨酸残基之间的连接。3.**纯度**:纯度达到95%以上,通过SDS-PAGE和完整ESI-MS进行确定。4.**储存稳定性**:在含有50%甘油的储存缓冲液中,好的活性和稳定性可维持长达24个月。5.**使用条件**:可以在原生或变性条件下使用,对于变性条件下的去糖基化,建议添加NP-40以解除SDS的抑制作用。6.**比活性**:具有高达100000U/mL的比活性。7.**His标签**:产品带有His标签,常用于抗体及其相关蛋白的完全去糖基化。8.储存条件:-25~-15℃保存,有效期1年。9.**无甘油版本**:还提供了无甘油版本的PNGaseF,这有助于在HPLC和质谱分析中获得结果。10.**酶活定义**:1个酶活力单位指在10μL的反应体系中,37℃条件下1小时从10μg变性RNaseB中除去超过95%的碳水化合物所需要的酶量。这些特点使得酵母重组表达的PNGaseF成为研究和分析糖蛋白糖链结构的重要工具。Recombinant Cynomolgus PCSK9 Protein,His Tag
Recombinant Cynomolgus PS20 Protein
T7 RNA聚合酶(高浓度)
Recombinant Mouse ECSCR Protein
Recombinant Human HMGB1(His Tag)
Biotinylated Recombinant Human 4-1BB/TNFRSF9 (His-Avi Tag)
Recombinant Human Kallikrein 3/PSAProtein
Recombinant Human CD58 Protein
Recombinant Human/Mouse/Rat Activin A Protein
Recombinant Mouse Glypican 1/GPC1 Protein
Recombinant Mouse TREM2 Protein