基因检测**前沿的两种方法是:高通量测序(NGS)和数字PCR(dPCR)。高通量测序技术又称“下一代”测序技术,可以一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,功能强大,但是实验操作较复杂,数据分析难度较大,检测周期长,成本较高。数字PCR技术是目前**精细**灵敏的基因检测技术,借助微液滴或微腔室,通过单个模板分子的PCR扩增,可实现不依赖于标准曲线和参照样本的***定量。与NGS相比,数字PCR灵敏度高、检测速度快、操作简便、结果易读、成本低廉等优势使其更适合临床检测,成为精细医疗实现平民化、大众化的比较好选择。此外,数字PCR还在基因表达差异研究、拷贝数变异(CNV)研究、低丰度DNA模板分子的精确定量、甲基化含量鉴定、二代测序辅助建库、CRISPR-Cas9基因编辑结果验证、转基因成分的检测、移植排异监控、肠道菌群分析以及***基因组检测等众多领域中有着优异的应用。样本多样性,样本通量可达96个样本,支持灵活设定。宁波微滴式数字PCR原理
数字PCR为juedui定量,qPCR为相对定量,数字PCR较qPCR更精细、更灵敏。所以说,未来数字PCR将成为qPCR的重要补充,在部分领域逐步替代荧光定量PCR。未来这些领域将广泛应用到数字PCR:科研:高校(生命科学学院、环境学院、医学院、药学院)等。医院:病理科、血液科、妇产科、心血管科、检验科、转化医学中心:研究院单位、疾控中心、海关(出入境检验检疫)、质监局、环境/环保局等。企业:第三方检测机构、IVD(分子体外诊断试剂)、生物制药等。常州微滴式数字PCR品牌MicroDrop™数字PCR是拥有完全自主知识产权的微滴式数字PCR仪。
MicroDrop-100系统产品特点:一、适应性广,灵活性高1、理论上可覆盖qPCR(荧光定量PCR)的所有应用2、样本多样性,样本通量可达96个样本,支持灵活设定3、开放式平台,支持用户自行开发试剂、产品。二、灵敏度高,准确性高1、***定量——无需依赖标准曲线2、采用微滴式技术高达100,000个的微滴3、线性范围达到6个数量级,灵敏度高达万分之一三、可分析复杂混合物1、准确度不完全依赖于扩增效率2、双通道荧光检测,支持EvaGreen染料及探针法3、支持多重数字PCR四、操作简单,使用方便1、全封闭防污染设计,一键式自动化操作。2、可选全中文分析软件
目前数字PCR技术在临床领域已经有着非常***且***地应用,例如在病原微生物检测中的应用:HBV检测、HIV检测、甲型流感病毒检测等;在产前诊断中的应用:13/18/21号染色体三倍体检测、遗传性耳聋检测、地中海贫血检测及优生五项的病毒检测等;在**靶向***相关基因检测中的应用:肺*EGFR基因突变、ALK基因融合检测、结直肠*KRAS、BRAF基因突变检测、乳腺*HER2基因 扩增检测、神经胶质瘤IDH基因突变检测等。以**靶向***相关基因检测为例,在**形成的超早期,会出现**细胞的坏死和凋亡,这些凋亡或坏死的**细胞会释放其DNA进入外周血,因此通过分析循环血液中是否含有**特异的游离DNA就可以达到**早期筛查的目的。然而此时DNA含量极低,对检测的灵敏度和精确性要求极高,目前只有数字PCR技术可以检测出来。另外进行个体化***时,需要对基因组样本进行分析,此时利用数字PCR技术也能**提高结果的可信性,进而建立合理***方案。单细胞研究:测序、PCR。
MicroDrop-100数字PCR系统具有如下优点:
1、JUE对定量,结果判读不需要依赖标准曲线;
2、突破局限,检测灵敏度可低至万分之一;
3、专利设计的具有高精度复杂三维微纳防污染结构的微流控芯片,单张可同时处理1-8个样本;
4、一键式自动操作,20uL PCR体系可生成100,000微滴,8个样本单次微滴生成*需2分钟;
5、FAM、HEX(VIC)双荧光通道,半导体激光器做为激发光源相比LED光源,稳定性高,功率稳定不影响检测灵敏度,单色性能优异降低对检测特异性的影响,且方向性好;
6、检测器为2个光电倍增管,灵敏度及增益优于MPCC或CCD,普通的硅光子计数器,增益为10^5,光电倍增管增益可以达到10^9;
7、**知识产权的软件系统可直接计算拷贝数、拷贝数浓度,CNV 值,突变丰度;阈值线可自动或手动完成,每个样本可单独设定阈值线;输出数据图标、直方图、一维图、二维图、浓度图、95%置信度不确定性区间等;软件可自动识别复杂微滴分簇四簇;软件具备数据质控功能,支持阳性微滴数、阴性微滴数、总微滴数统计及这些指标的任意组合;单个样本100,000微滴的反应体系以及高灵敏度的检测系统,配以独特的软件系统,可以实现高达20重的PCR分析;
8、单次检测通量96个样本,操作灵活; 双通道荧光检测,支持EvaGreen染料及探针法。杭州微滴式数字PCR报价
分辨率——低至0.1倍基因表达差异。宁波微滴式数字PCR原理
dPCR的基本原理目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。宁波微滴式数字PCR原理
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