数字PCR采用的策略概括起来非常简单,就是“分而治之”(divide and conquer)[1],这种做法非常类似于计算机科学中的“分治算法”,将一个标准PCR反应分配到大量微小的反应器中,在每个反应器中包含或不包含一个或多个拷贝的目标分子( DNA模板) ,实现“单分子模板PCR扩增”,扩增结束后,通过阳性反应器的数目“数出”目标序列的拷贝数。在实际的数字PCR实验中,事实上是通过呈现两种信号类型的反应器比例和数目进行统计学分析,计算出原始样本中的模板拷贝数。FAM、VIC双通道荧光检测。北京广州永诺数字PCR
数字PCR的应用
检验检疫 食品安全
•转基因食品检测(国标)
•病原菌鉴定
•动物源性检测分析
科研
•基因表达差异监测
•CRISPR-Cas9基因编辑结果验证
•甲基化含量鉴定
•单细胞研究:测序、PCR
临床
•**液体活检:早筛、用药、监测、复发
•无创产前筛查:低成本、快速
•***性疾病:HBV、HIV定量
据悉,MiniDrop™**团队由微流控、光学、机电学、化学、临床医学、分子生物学等多学科交叉领域的**组成,依托精密仪器研发、生物纳米材料与分子生物学等平台,以微滴式数字PCR仪为**,打造了全自动液体处理工作站、核酸提取试剂盒等创新产品,致力于解决**、***领域的精细诊断。
北京广州永诺数字PCR无创产前筛查:低成本、快速。
要了解为什么传统 PCR 存在限制,务必要了解 PCR 反应过程中发生了什么。基本 PCR 运行可以分为三个阶段:
指数期
每个循环积聚的产物准确加倍(假定 ** 反应效率)。该反应具有高度特异性和精确度。出现指数式扩增,因为所有试剂均新鲜可用,反应的动力学推动反应有利于扩增子加倍。
线性期(高变异性)
随着反应继续,一些试剂因扩增而被消耗。反应开始减缓,并且每个循环的 PCR 产物不再加倍。
平台期(终点:使用传统方法进行凝胶检测)
反应停止,不再产生更多产物,并且如果放置时间够长,PCR 产物将开始降解。因为每个样品具有不同的反应动力学,所以每支试管或每个反应将在不同的时间点进入平台期。在平台期可以看到这些差异。在平台期内,传统 PCR 进行测量,又称为终点检测。
相对于二代测序、基因芯片和定量PCR而言,数字PCR具备以下优势:
· 能够有效区分浓度差异微小的样品:更好的准确度、精密度和重复性,可以用于精确测定靶基因的相对表达,基因拷贝数变异分析等。
· 数字PCR可开发针对不同**、不同样本以及不同的样本环境提供检测解决方案,该技术的应用范围广,尤其在液体活检领域,已开发针对肺*、乳腺*、肠*、胃*等上百个位点检测试剂盒,可精细指导临床***的诊断,以便患者在后续得到更及时并且适当的***方案提供。 全封闭体系,自动化流程操作。
研究方向基因表达差异研究
检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的***定量,从而提供了比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况:microRNA、lncRNAs等的表达分析、等位基因的不平衡表达、单细胞基因表达分析、Exosome内核酸分子定量分析等。
拷贝数变异(CNV)研究
微滴化的样品处理及检测,这种摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的***拷贝数,为拷贝数变异的研究提供了***的检测精度。是其他诸如二代测序、芯片杂交等平台无法达到的,因此采用数字PCR能够有效对NGS、aCGH的实验结果进行验证,并具有成本低、通量高的特点。
双通道荧光检测,支持EvaGreen染料及探针法。北京广州永诺数字PCR
国内拥有完全自主知识产权的微滴式数字PCR仪。北京广州永诺数字PCR
定量PCR和数字PCR的特点:
5. 目前定量PCR已经能实现高通量样品条件下的自动化操作。
6. 数字PCR在单分子层面上的***定量,可以彻底摆脱对标准曲线的依赖而直接给出靶序列的拷贝数,提高了实验结果在批内和批间的稳定性,甚至能用来对标准品进行定标。
7. 基于***定量的方式,数字PCR结果的高重复性和高精度可实现微小差异的基因表达分析,如等位基因的不平衡表达、单细胞基因表达分析、microRNA表达分析等等。所谓“微小差异”的标准一般而言是指表达水平的差异在2倍以内。
8. 同等条件下,数字PCR在灵敏度方面拥有优势,使得该技术已成为**的液态活检、病原微生物检测、转基因成分测定、宿主残留DNA分析等的热门技术。
浚和(上海)仪器有限公司是一家供应国内外先进仪器和设备的专业供应商和服务商,致力于为客户提供专业的定制化解决方案。多年来,持续为医药、化工、高校、科研单位、检测院等多个行业提供先进的产品和专业的服务。
浚和在不断引进国内外先进仪器设备的同时,结合行业和市场需求,加强和客户之间的沟通,并与国际上多家**仪器设备制造商保持着长期稳定的合作关系,不定期地与合作商进行技术交流,努力加强自身技术力量。公司配备了数名有着多年行业经验的技术人员,依靠雄厚的技术实力、科学合理的配置方案、专业的安装调试和周到的售后服务,得到了广大用户的支持与信赖。
公司主要经营产品包括:等离子清洗机、真空泵、喷雾干燥器、数字PCR、高压灭菌锅、培养箱、切片机、水分测定仪、激光粒度仪、光谱仪、温湿度记录仪等,目前主要合作品牌有:日本雅马拓YAMATO、日本KASHIYAMA、日本HORIBA、广州永诺 、日本KEM等。同时,公司还提供专业的技术服务,如设备的维护、验证等。
浚和仪器将始终以行业特点为立足点,以客户需求为导向,不断地提高自身专业技术能力,不停地完善客户服务质量,在发展中保持创新的精神,力求与客户共同进步,为行业的发展作出不懈的努力。