m6A修饰图谱构建及作用机制:通过m6A甲基化测序(MeRIP-Seq,miCLIP)构建疾病细胞模型或者发病组织的m6A修饰谱,分析m6A的motif,peaks数量及分布,Peak关联基因的特征,联合RNA-seq研究m6A甲基化与表达的关系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)为研究ALKBH5的m6A作用机制,作者利用芯片和m6A-seq筛选到胶质瘤增殖相关的FOXM1,通过qPCR、WB、免疫荧光、核质分离WB/qPCR、RIP和MeRIP等实验证明ALKBH5通过去甲基化调节FOXM1在GSCs中的表达。为研究ALKBH5对FOXM1的作用是否受其他因子的调节,作者研究了FOXM1的邻近基因,发现lncRNAFOXM1-AS与FOXM1序列互补,且共表达、共定位,进一步通过RIP,RNApulldown等实验证明lncRNAFOXM1-AS促进ALKBH5和FOXM1初级转录本的相互作用。通过细胞实验进一步验证ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下维持FOXM1的表达和细胞增殖,从而维持GSCs的干性。图3ALKBH5敲除细胞中m6A修饰的特征和基因表达的变化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表观遗传改变极大地促进了人类症的发生。传统的表观遗传研究主要集中在DNA甲基化,组蛋白修饰和染色质重构。近。可以普遍应用于生物医学研究、药物筛选、肿、瘤诊断等领域。病理科研技术服务实验室

首先,预实验必须要当做正式实验来对待(态度要放端正,这是必须的)。预实验的每一步都需要详细规划,多方筹谋。不论是实验动物的选择,还是检测试剂的购买,都尽量和正式实验统一标准。建议大家先把所有试剂和药物购买完毕后,再去购买实验动物。因为动物会长胖,长胖后给药剂量就要增加,不仅多花钱,并且还容易影响实验效果。笔者曾经提前将实验动物买回,但因为特殊原因没能购买到造模药物,**终只能忍痛割爱将动物赠送他人,白白亏了一笔血汗钱(那批老鼠在我这儿白吃白喝长得太胖,没办法用作造模)。动物及试剂购买首先需要考虑:实验动物品种、体重、性别、周龄(通常根据既往文献报道可以获得答案)、数量(需要考虑到实验有一定动物死亡率或者动物本身会打架互殴,因此需要提前购买足够的动物)。动物购买的途径、安置的地点,饮食管理(一般实验室会有动物房,也可以从其他地方购买),动物免疫证明、伦理证明需要提前准备好。实验相关的试剂和药物:比如造模药物和器械,动物干预所需药物,阳***物选择及购买(有些药物购买很困难,必须通过特殊程序才能买到)。如果涉及到有创操作,要提前准备好**物(***建议提前购买),手术器械。黑龙江外包科研技术服务外包培养基有很多不同的名字是因为根据不同细胞的培养和应用场景。

小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴,引起轻微的血管扩张;用无菌手术刀、刀片或锋利的剪刀,快速截断小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次,之后每次需截除2-3毫米;从尾部像尾尖方向按摩,增加血流;用采集血液;结束后,按压伤口或使用止血剂来止血;每次量大约可达。小鼠眼球取血单手保定好小鼠;必要时剪掉小鼠胡须,防止污染血液;轻压取血侧眼部皮肤,使眼球充血突出;用弯头镊夹取眼球并快速在摘取;同时用左手中指轻按小鼠心脏部位,以加快心脏泵血速度;当血液流尽时,用脱臼法处死小鼠;大鼠眼眶取血先将小鼠进行麻醉,大鼠翻正反射消失时不在继续麻醉;抗凝处理过的玻璃毛细采样管,掰成2-3厘米长度;右手食指和拇指轻按眼眶两侧皮肤,使眼球突出,毛细管从内侧的眼球与眼睑的缝隙处进入,轻轻旋转毛细管,稍微深入眼球后上方,血液流速快的时候4-5滴即可,温柔的将毛细管取出;用棉签按压大鼠眼眶止血,每次可取血50-100微升,将血液放入冰盒中保存。小鼠心脏取血先将小鼠麻醉,稍靠右侧平躺在手术板上固定;左侧第三四根肋骨间触摸心脏,跳动明显,慢慢进针;针有回血停止进针,开始取血;一次可以300到500微升,小鼠存活,放到加热垫上待小鼠苏醒后放入笼中。
用途基因功能研究、免/杀伤/增殖等、抗体活性筛选(细胞水平的结合和阻断)、CAR分子的杀伤活性评价。材料与仪器(以慢pMSCV载体为例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV质粒、带有eGFP-Tag的pMSCV空载质粒、GAG质粒、VSV质粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T细胞、opti-MEM、DMEM、FBS、双抗、μm的滤膜、荧光显微镜等。步骤1、基因的构建1)根据目的基因mRNA编码区设计引物,分别在引物两端加入酶切位点EcoRI和BglII。2)从细胞中提取目的基因mRNA,然后逆转录成cDNA,然后从cDNA里面用引物把目的基因的CDS区扩增出来。PCR扩增出带有酶切位点的目的基因编码区序列,连接至pMD19-T载体后转化至感受态DH5α,分别进行菌落PCR鉴定和酶切鉴定。3)使用EcoRI和BglII双酶切下目的基因序列,电泳割胶回收纯化,连接到pMSCV-eGFP载体。再次转化到感受态DH5α,菌落PCR鉴定和酶切鉴定成功后,送至公司测序、鉴定。4)鉴定成功后,将质粒转化至感受态DH5α中,并进行无内质粒抽提。GAG质粒和VSV质粒同样可以转化至感受态DH5α中,并进行无内质粒抽提。质粒抽提后冷冻于-20℃保存。2、慢包装1)使用DMEM完全培养基培养6cm皿HEK293T至汇合度为70~80%。动物实验这些取样细节,你有注意吗?

m6A研究又有新手段了?赶紧来了解一下吧!栏目:研究动态发布时间:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,目前主要的研究思路包括差异表达的write,reader和eraser基因分析;m6A抗体检测全转录组甲基化水平;分析m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在7月25日的Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章,小编时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了MazF能特异性的识别无修饰的ACA序列并发挥RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的个A发生m6A甲基化之后将无法被MazF所识别,如图一所示。图1MazFRNA酶作用示意图根据这一原理,作者将纯化后的mRNA进行MazF酶处理,然后再对打断的RNA进行逆转建库测序。对于无修饰的位点,ACA处被完全剪切,测序reads正好分布于该位点上下游而且比对至该处的上下游reads数是相同的.如图2所示。而甲基化位点的reads会包含上下游的序列。作者开发了MAZTER-MINE软件包专门进行分析(图3)。动物模型的表现与人类疾病可能存在差异,因此需要谨慎使用。河北小鼠科研技术服务外包
干货分享|选对实验室常用培养基DMEM和1640。病理科研技术服务实验室
我们知道WB实验步骤繁琐,一次实验历时也不短,从提蛋白到显影结束可能要三天,我们就讲一下这里面的一些关键环节。一、蛋白提取及变性1、提取蛋白很多经验丰富的WB实验者都深有体会,蛋白提取是影响结重要的环节之一。该过程重要的是防降解和保证蛋白浓度不要太低。防降解主要有两点,一是裂解前注意保持样品处于低温环境中,二是裂解时加入足够的蛋白酶抑制剂。我们习惯先用冰冷的PBS做心脏的体循环灌注,然后冰上取脑,分离各脑区(嗅球,皮层,海马,中脑,小脑,延髓,丘脑,纹状体)后置于,用液氮速冻后转移至-80度冰箱长期保存。接着是保证蛋白浓度,即要加入适量的裂解液,加太少会使蛋白提取不充分,加太多会让蛋白浓度太低,一般经验是这样的,细胞样品例如一个六孔板的细胞加60微升的裂解液,动物组织的话每毫克组织加10微升裂解液。还要加上超声破碎处理,具体方案见讨论部分。如果没有超声破碎仪,那就用1毫升注射器不断抽吸,冰上反复抽吸1分钟左右,注意不要产生过多气泡。(需要灌注取材的视频可以私聊获取,由于文件过大,又比较血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白变性加入上样缓冲液后100摄氏度煮10分钟,这里的上样缓冲液有两种可选。病理科研技术服务实验室