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m6A研究又有新手段了？赶紧来了解一下吧！栏目：研究动态发布时间：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一，目前主要的研究思路包括差异表达的write，reader和eraser基因分析；m6A抗体检测全转录组甲基化水平；分析m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在7月25日的Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章，小编时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了MazF能特异性的识别无修饰的ACA序列并发挥RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的个A发生m6A甲基化之后将无法被MazF所识别，如图一所示。图1MazFRNA酶作用示意图根据这一原理，作者将纯化后的mRNA进行MazF酶处理，然后再对打断的RNA进行逆转建库测序。对于无修饰的位点，ACA处被完全剪切，测序reads正好分布于该位点上下游而且比对至该处的上下游reads数是相同的.如图2所示。而甲基化位点的reads会包含上下游的序列。作者开发了MAZTER-MINE软件包专门进行分析（图3）。通过不同分组之间的细胞对于划痕区修复能力的不同，可以判断各组细胞的迁移与修复能力的差别。浙江病理科研技术服务构建

METTL3能够促进肺腺细胞的生长、生存和侵袭，但还不清楚它是否作为m6A调节器或效应器发挥作用[25]。在急性髓细胞白血病（AML）患者中，m(6)A调控基因的突变或拷贝数变化与TP53突变存在密切联系，且m(6)A调控基因的改变与AML不良预相关[26]。此外，FTO在AML中高表达，它通过降低mRNA转录本中的m(6)水平，调节ASB2和RARA等靶点的表达，增强了白血病基因介导的细胞转化和白血病形成，并抑制全反式维甲酸(ATRA)诱导的AML细胞分化[27]。在脂肪形成过程中，FTO表达与m6A水平成负相关，促进脂肪形成[3]。在胶质细胞瘤样细胞中，ALKBH5通过lncRNAFOXM1介导FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修饰维持胶质瘤细胞的成瘤性[28]。此外，甲基转移酶METTL3或METTL14的敲除，能够改变m6A的富集和ADAM19的表达，极大地促进了胶质瘤细胞的生长、自我更新和形成[29]。图2m6ARNA修饰和介导的功能[30]m6A的研究方向主要是通过研究m6A修饰相关的甲基化、去甲基化酶和识别蛋白的功能，进而研究m6A修饰的生物学功能和作用机制：一般通过敲除m6A酶分子，研究下游功能基因分子的表达和m6A甲基化情况，通过介导相关基因异常（可变剪切、稳定性、翻译、miRNA调控）影响细胞表型和功能特征。海南小鼠科研技术服务培养常用于研究细胞的成瘤能力、细胞的转移、细胞的耐药和靶分子对肿瘤细胞的发展的影响等等。

采用opti-MEM和Lipo3000分别转染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG质粒及对照载体，每皿加入脂质体-质粒转染混悬液按购买脂质体相关说明书操作定量。继续培养24h。2)24小时后，将培养基更换为新鲜的DMEM完全培养基，放进细胞培养箱继续培养48~72h。3)48~72h后收集上层培养液，并过μm滤膜，采用ELISA法对所获得的慢载体进行滴度测定。如不及时使用可以冻存于-80℃。3、慢转染1)转染前1天将细胞接种6孔培养板，时细胞的融合率约为50%，前需换液，加入1mLDMEM完全培养基。2)冰浴融化后加入相应体积的液及聚凝胺（Polybrene），混匀后放入37℃孵箱中继续培养3)4h后补充1mL培养基，14h后换液（24h内换液即可）。4)72h后用倒置显微镜观察荧光，监测效率，出现较多荧光时将等量的转染细胞和未转染细胞分别加入等浓度Puromycin（Puromycin或其他筛选浓度需要事先摸索）。5)待未转染细胞全部死亡并且可观察到满意荧光量时，降低Puromycin浓度培养。也可以挑去单克隆细胞株进行进一步培养，以得到满意的稳定表达目的基因的细胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法检测目的基因的表达量和蛋白水平是否显著提高。7)由此可得三组细胞株：a.正常细胞株；b.空载载体的细胞株。

制作该模型的方法为大鼠腹腔麻醉消毒后选取腹部正中切口打开腹腔长约2cm，寻找盲肠，小心分离其远端与大肠的系膜，在盲肠远端1/2处用无菌4号丝线紧紧结扎，并用无菌7号针头在已结扎盲肠远端处贯通穿刺，然后把盲肠推回腹腔，关闭腹腔。影响因素多数研究一致认为盲肠结扎位置是CLP模型中死亡率和疾病严重程度的主要决定因素。结论为：①结扎25%或以下的盲肠死亡率几乎为零，为轻度脓毒症；②结扎50%～60%的盲肠导致术后死亡率为60%，为中度脓毒症；③结扎75%或以上的盲肠导致小鼠在术后2～3d内全部死亡，为重度脓毒症。而在不同程度脓毒症中，死亡主要集中在初的48h内。有研究通过改变盲肠结扎位置和穿刺针直径来调节脓毒症的严重程度，其中提到与结扎长度小于1cm的小鼠相比，结扎长度超过1cm的小鼠死亡率增加至100%；增加穿刺针的直径也使得存活率从100%（22G针）降低至55%（19G针）。结论为：在上述两个因素中，盲肠结扎位置比针头大小影响更为。CLP诱导的脓毒症术后6h即可出现菌血症，术后约12h出现脓毒症相关临床症状，包括发热、寒战、毛发竖立、全身无力和活动减少等，术后18h开始死亡。总之，在制作CLP模型时。随着跨学科研究的深入开展，动物疾病模型将在未来发挥更为普遍的作用，成为生命科学、医学等领域研究工具。

是整体甲基化进程所必须的[2]。FTO是ALKB家族的成员，作为个被发现的去甲基酶，可影响剪切因子SRSF2的RNA结合能力，进而调控pre-mRNA的剪切加工过程[3]。目前已发现FTO调节异常与肥胖、大脑畸形和生长迟缓相关，揭示m6A可能对这些疾病具有重要的调节功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被发现具有去甲基作用的另一个成员，以RNaseA敏感的方式与核小斑共定位，它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外，ALKBH5和它的去甲基化活性影响新生mRNA合的成和剪切效率[7]，且ALKBH5敲除雄性小鼠表现出精子发生异常，这可能是精子发生相关基因表达改变的结果[7]。m6AmRNA修饰执行其功能主要通过两个途径：精细调控甲基化转录本的结构，以阻止或诱使蛋白-RNA相互作用；或被直接由m6A结合蛋白识别，诱发续反应。目前一类含有YTH功能结构域的蛋白被鉴定为m6A修饰的结合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2己被证实是ｍ６Ａ的结合蛋白.YTHDF1主要影响ｍ６Ａ修饰基因的翻译，YTHDF2主要影响ｍ６Ａ修饰基因的降解，而YTHDC1结合ｍ６Ａ修饰的基因影响其剪接。HNRNPC是一种丰富的核RNA结合蛋白，参与pre-mRNA的加工[8]。慢病毒载体包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息。广西实验科研技术服务培养

裸鼠皮下成瘤模型造模意义.浙江病理科研技术服务构建

我们知道WB实验步骤繁琐，一次实验历时也不短，从提蛋白到显影结束可能要三天，我们就讲一下这里面的一些关键环节。一、蛋白提取及变性1、提取蛋白很多经验丰富的WB实验者都深有体会，蛋白提取是影响结重要的环节之一。该过程重要的是防降解和保证蛋白浓度不要太低。防降解主要有两点，一是裂解前注意保持样品处于低温环境中，二是裂解时加入足够的蛋白酶抑制剂。我们习惯先用冰冷的PBS做心脏的体循环灌注，然后冰上取脑，分离各脑区(嗅球，皮层，海马，中脑，小脑，延髓，丘脑，纹状体)后置于，用液氮速冻后转移至-80度冰箱长期保存。接着是保证蛋白浓度，即要加入适量的裂解液，加太少会使蛋白提取不充分，加太多会让蛋白浓度太低，一般经验是这样的，细胞样品例如一个六孔板的细胞加60微升的裂解液，动物组织的话每毫克组织加10微升裂解液。还要加上超声破碎处理，具体方案见讨论部分。如果没有超声破碎仪，那就用1毫升注射器不断抽吸，冰上反复抽吸1分钟左右，注意不要产生过多气泡。(需要灌注取材的视频可以私聊获取，由于文件过大，又比较血腥，不宜直接放到文章里。)2、蛋白变性加入上样缓冲液后100摄氏度煮10分钟，这里的上样缓冲液有两种可选。浙江病理科研技术服务构建