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m6A研究又有新手段了？赶紧来了解一下吧！栏目：研究动态发布时间：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一，目前主要的研究思路包括差异表达的write，reader和eraser基因分析；m6A抗体检测全转录组甲基化水平；分析m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在7月25日的Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章，小编时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了MazF能特异性的识别无修饰的ACA序列并发挥RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的个A发生m6A甲基化之后将无法被MazF所识别，如图一所示。图1MazFRNA酶作用示意图根据这一原理，作者将纯化后的mRNA进行MazF酶处理，然后再对打断的RNA进行逆转建库测序。对于无修饰的位点，ACA处被完全剪切，测序reads正好分布于该位点上下游而且比对至该处的上下游reads数是相同的.如图2所示。而甲基化位点的reads会包含上下游的序列。作者开发了MAZTER-MINE软件包专门进行分析（图3）。免疫沉淀技术是一种研究蛋白质间交互作用的生物技术。广西外包科研技术服务实验室

图2MAZTER-Seq实验流程图图3MAZTER-MINE分析m6A示意图接下来作者便是要验证这一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情况下，检测到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗体富集后的样品剪切效率也低于未富集的Input组。整体水平可靠，那检测的特异性位点是否准确呢？作者也将该方法检测到的新甲基化位点使用放射标记层析检测，发现预测的位点准确存在而且与剪切效率相符合。如图5所示。而图6中，作者则是与m6A抗体IP的方法进行了比较，也证实了这一方法的可行性。图5MAZTER-Seq检测结果验证图6MAZTER-Seq与m6A-Seq比较分析此外，后文中作者也在大规模的CRISPR-Cas9改变m6A状态和酵母减数分裂模型中检测了MAZTER-Seq这一系统；并进一步通过这一方法检测了哺乳动物不同细胞间m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO对整体m6A甲基化水平的影响等。这里小编主要给大家分享这一新技术，其他部分暂不过多分析了。新的技术能拓展我们的研究内容；对于这一技术。海南哪里有科研技术服务分离动物疾病模型在科研中发挥了巨大的作用，但也存在一些挑战。

3）基因/蛋白质表达定性或定量检测在进行分子检测的过程中，保持核酸和蛋白质的完整性至关重要，因此在取样过程中，应尽量避免核酸及蛋白质的降解。如不注意采样过程，将会导致样本中的核酸及蛋白质的无差别降解，严重影响后续分子检测结果。在条件允许的情况下，样本在离体后应立刻装入冻存管内，并立即放入液氮中进行冷冻。在RNA提取样本的保存过程中，可以选择非冷冻型RNA保存液或Trizol试剂进行RNA酶的。针对蛋白质提取样本的保存，我们同样可以使用商品化的蛋白酶剂进行短期处理。聚合酶链式反应（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印迹（Westernblotting，WB），这两种实验手段是分子学检测中不可或缺的一部分，也是发表至关重要的分子检测数据。PCR主要用来对基因在基因组层面或转录层面的变化进行定性或定量检测，而WB则主要用来对某一蛋白质的表达进行定量检测。（4）转录组学、蛋白质组学及代谢组学检测随着检测水平及相关产业的不断发展，各类组学检测的价格降低，实验设计中也常常运用组学检测来提升实验设计的档次。在我们进行转录组学及蛋白质组学的检测过程中，同样是要首先确保目标RNA或蛋白质的片段完整性。

首先，预实验必须要当做正式实验来对待（态度要放端正，这是必须的）。预实验的每一步都需要详细规划，多方筹谋。不论是实验动物的选择，还是检测试剂的购买，都尽量和正式实验统一标准。建议大家先把所有试剂和药物购买完毕后，再去购买实验动物。因为动物会长胖，长胖后给药剂量就要增加，不仅多花钱，并且还容易影响实验效果。笔者曾经提前将实验动物买回，但因为特殊原因没能购买到造模药物，**终只能忍痛割爱将动物赠送他人，白白亏了一笔血汗钱（那批老鼠在我这儿白吃白喝长得太胖，没办法用作造模）。动物及试剂购买首先需要考虑：实验动物品种、体重、性别、周龄（通常根据既往文献报道可以获得答案）、数量（需要考虑到实验有一定动物死亡率或者动物本身会打架互殴，因此需要提前购买足够的动物）。动物购买的途径、安置的地点，饮食管理（一般实验室会有动物房，也可以从其他地方购买），动物免疫证明、伦理证明需要提前准备好。实验相关的试剂和药物：比如造模药物和器械，动物干预所需药物，阳***物选择及购买（有些药物购买很困难，必须通过特殊程序才能买到）。如果涉及到有创操作，要提前准备好**物（***建议提前购买），手术器械。EdU细胞增殖检测是一种快速、准确、灵敏的细胞增殖检测方法.

准备碎冰和。把膜置于甲醇溶液中活化1分钟，然后转移至转膜液中平衡3分钟后备用。2、转膜组装转膜三明治夹，这一步很关键，重要的是胶和膜之间不能有气泡且膜与胶要保证贴合紧密(否则会翻车)，可以加多点转膜液泡着。组装好后加满转膜液，设置电源参数，我习惯恒流转膜，200-280毫安，1-2小时，根据分子量定，如50KD的分子用60分钟就够了。如果一个电源带两个转膜大槽即四块胶，我就会用恒压70-110V。这个过程重要的是做好降温。这里简单说一下蛋白分子量与玻璃板厚度，分离胶的浓度，转膜电源参数的选择问题。如果是能用1毫米的玻璃板就不用，因为转膜是在电场的作用下蛋白分子从胶上迁移到膜上，1毫米胶的蛋白迁移距离要比。选择更薄的胶蛋白转膜时间可以减少，从而减少发热，以免胶变形，条带也会更好看。然后是分离胶的浓度，如果是150—200KD的分子选10%以下的的分离胶，200—300KD的选8%的,300KD以上的选6%的，小于30KD的200mA30分钟，30-100KD的按分子量的数值算，如70KD，250mA70分钟;100-150KD的250mA100分钟;150—300KD的分子转膜条件用280毫安(以上均是对于，)，120分钟足矣，前提是胶的浓度相适应。五、封闭孵一抗1、封闭转膜结束后。原代心肌细胞培养传代。海南乳鼠科研技术服务购买

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且研究表明HNRNPC通过m6A与RNA结合调控目标转录本的丰度和选择性剪切[9].图1m6A修饰的酶系统[10]m6A生物学功能越来越多的证据表明m6A修饰在哺乳动物中发挥重要的生物功能。例如，在转录水平上调控RNA的稳定性[11]、定位[12]、运输、剪切[13]和翻译[14]。ClaudioR.等发现依赖METTL3的pri-miRNA甲基化，会促进DGCR8识别和加工，从而促进microRNA的成熟[15]。此外，m6A识别蛋白HNRNPA2B1促进pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外，环状RNA上m6A的修饰能促进环状RNA的翻译[17]。m6A修饰在基因表达调控中起着重要的作用，其调控机制的异常可能与人类疾病或相关。目前发现m6A可能会影响精子发育（ALKBH5，METTL3，Ythdc2）、发育（METTL3、FTO、ALKBH5）、免疫（METTL3）、UV诱导的DNA损伤反应（METTL3，FTO）、生成（YTHDF2）或转移（METTL14）、干细胞更新（METTL14）、脂肪分化（FTO）、生物节律、细胞发育分化、细胞分裂及其它的一些生命过程。例如，ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修饰，其特点是凋亡影响减数分裂中期的精子细胞，引起生育能力受损[7]。METTL3和METTL14增加弱精症精子的m6A水平[18]，在生殖细胞中，METTL3的敲除严重抑制精子分化和减数分裂的发生。广西外包科研技术服务实验室