16SrRNA基因测序以细菌16SrRNA基因测序为主,主要是研究样品中的物种分类、物种丰度系统进化、功能预测以及微生物与环境互作关系等。16SrRNA基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因,长度约为1542bp,其分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中常用和有用的标志。16SrRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。16SrDNA是细菌染色体上编码16SrRNA相对应的DNA序列,16srRNA是由16srDNA转录来的,一般扩增检测和分析的对象都是16srDNA。如何确定肠道菌群失调?上海肠道菌群全长检测
据医学文献检索引擎PubMed统计,相较于2007年,2017年以肠道微生物为研究方向的论文数量增加了13倍,研究领域涉及肥胖、糖尿病、cancer、自闭症等50余种疾病,肠道微生态诊疗已经成为欧美医学**为热门的研究方向之一。作为人体营养吸收与物质代谢主要的渠道,肠道内寄生着数量为庞大的微生物菌群,人体内的肠道微生物数量大约100万亿个,超过人体自身细胞总量的10倍以上,足有几公斤重。另一方面,肠道菌群的健康与否直接影响着宿主的免疫、营养物质合成及药物代谢等,甚至按照“肠脑轴”的理念,大脑、肠道共同构成的系统以内分泌和神经讯息的形式进行沟通,共同调节了我们的情绪反应、新陈代谢、免疫系统、大脑发育与健康,所以肠道菌群是否健康直接决定了作为宿主的人体健康。山东粪便菌群检测临床应用上海沃本--目前肠道菌群检测的靠谱产品;
某些肠道细菌被认为是AS疾病进展的新因素。研究发现,中国AS患者的类杆菌属(Bacteroides)和普雷沃氏菌属(Prevotella)相对减少,而链球菌属(Streptococcus)和大肠埃希菌属(Escherichia)富集。然而,在波兰东部,总胆固醇水平和低密度脂蛋白胆固醇值高的中年男性肠道中富含普雷沃氏菌属(Prevotella),但是梭菌属(Clostridium)和粪杆菌属(Faecalibacterium)含量较低。例如,一些AS患者的条件致病菌柯林斯氏菌属(Collinsella)增多。同时,有些微生物也可以降低AS斑块的形成。比如,在患者和小鼠模型中均发现,产丁酸盐的细菌罗斯伯里氏菌属(Roseburia)和真杆菌属(Eubacterium)的相对减少与AS病变的发展呈负相关关系。据推测,这些微生物可能会影响宿主的炎症水平。
约50%的类风湿关节炎(RA)患者对甲氨蝶呤改善不产生充分的应答,但缺乏可预测患者应答的预后标志物。Arthritis and Rheumatology上发表的一项研究,对比分析了对甲氨蝶呤改善应答及不应答的RA患者在改善前的肠道菌群差异,发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤改善的应答。另外,体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明,肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或消失可能抑制甲氨蝶呤的改善效果。①纳入26名新发RA患者,16名对甲氨蝶呤改善不应答;②应答患者与不应答患者的粪便菌群多样性、组成及功能存在差异;③不应答患者的菌群多样性更高,厚壁菌门/拟杆菌门比值增加,广古菌门丰度升高,MAPK信号、DNA复制、脂肪酸降解、嘌呤代谢等相关通路明显富集;④在另外21名新发RA患者中,基于菌群的模型可较准确地预测对甲氨蝶呤改善的应答(AUC=0.84);⑤体外共培养患者的粪便菌群与甲氨蝶呤,培养后的甲氨蝶呤水平与患者应答明显相关。如何评价肠道菌群检测的差异性?
有研究显示肠道菌群变化会影响代谢内稳态,而肠道菌群和代谢的扰动或促进类风湿性关节炎的早期发展。山东第一医科大学Jinxiang Han、华中科技大学宁康和山东大学张磊与研究团队在Gut发表文章,招募健康对照(27)、骨性关节炎(OA,19)和类风湿关节炎(RA,76)患者,对肠道宏基因组、临床表型、血液和膝关节滑液中的代谢物进行分析,发现大肠杆菌和牛链球菌促进抗坏血酸的降解,促进促炎反应,加速炎症性关节炎的发展。即肠道菌群可调控RA的进展,或成为RA的潜在靶点。肠道菌群都干些什么?菌群检测来告诉你。陕西专业菌群检测报告内容
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过去的研究已鉴定出多个类风湿关节炎(RA)相关的基因突变,而肠道菌群是RA的环境风险因素之一。The Lancet Rheumatology上发表的一项横断面研究,在非RA患者中发现,并在RA高危受试者中验证,普氏菌属与RA的遗传风险明显相关,普氏菌属还与RA高危受试者的临床前期症状相关。①纳入1650名非RA双胞胎,基于233个GWAS鉴定出的RA相关SNP,评估受试者的RA多基因风险评分(PRS);②在6776名受试者(包括2686名RA患者)中,基于逻辑回归对RAPRS进行验证;③对受试者的粪便菌群进行测序,分析菌群与RAPRS的关联;④在非RA受试者中,普氏菌属与RAPRS呈明显正相关,在RA高危受试者(RA患者的直系亲属)中也存在这种关联;⑤另外,包括普氏菌属在内的7个菌属与RA的临床前期症状(ACPA或RF阳性等)相关。上海肠道菌群全长检测