自从引入了细菌的基因组学分析以来,针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法,常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异,因为这种差异通常很小。相反地,宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组,这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。肠道菌群检测:对抗代谢性疾病新武器;江苏神经类疾病菌群检测常用方法
可分泌IL-10的调节性B细胞(Breg)对肠道菌群信号的应答在维持免疫耐受中发挥重要作用。CellMetabolism上发表的一项研究,在类风湿关节炎患者及关节炎小鼠模型中均观察到粪便丁酸盐水平的降低,而补充丁酸盐可缓解小鼠的关节炎。机制上,丁酸盐可通过促进菌群代谢产物——5-羟基吲哚-3-乙酸的产生,到达Breg上的芳香烃受体,以增强Breg的免疫抑制功能。①类风湿关节炎患者的粪便丁酸盐水平降低,与CD19+CD24hiCD38hiB细胞及IL-10+Breg的减少相关;②关节炎小鼠模型的粪便丁酸盐及乙酸盐水平降低,补充丁酸盐可以Breg依赖性方式缓解关节炎;③补充丁酸盐可增强Breg的免疫抑制功能,并抑制生发中心B细胞及浆母细胞的分化;④机制上,补充丁酸盐促进了菌群将5羟色胺代谢为5-羟基吲哚-3-乙酸,从而到达芳香烃受体,以活化Breg中的芳香烃受体依赖性基因转录。山东消化道疾病菌群检测准确性高肠道菌群检测--科研前沿的应用。
安徽医科大学的李宝珠团队Rheumatology上发表的一篇系统性综述,纳入26项研究的结果,总结了类风湿关节炎(RA)患者的口腔菌群与肠道菌群的组成及多样性的变化。①总结26项研究的结果,分析RA患者的口腔菌群与肠道菌群变化;②3项以上的研究报道,与对照相比,早发性RA/RA患者的肠道菌群中的粪杆菌属减少,而口腔菌群中的普氏菌属增加,链球菌属及嗜血杆菌属减少;③另外,部分普氏菌属中的物种(包括P.histicola及P.oulorum)在RA患者的口腔菌群中有增加趋势;④RA患者的口腔菌群α-多样性增加或不变,而肠道菌群α-多样性降低或不变
有研究显示肠道菌群变化会影响代谢内稳态,而肠道菌群和代谢的扰动或促进类风湿性关节炎的早期发展。山东第一医科大学JinxiangHan、华中科技大学宁康和山东大学张磊与研究团队在Gut发表文章,招募健康对照(27)、骨性关节炎(OA,19)和类风湿关节炎(RA,76)患者,对肠道宏基因组、临床表型、血液和膝关节滑液中的代谢物进行分析,发现大肠杆菌和牛链球菌促进抗坏血酸的降解,促进促炎反应,加速炎症性关节炎的发展。即肠道菌群可调控RA的进展,或成为RA的潜在靶点。 上海沃本--专业的肠道菌群检测专业团队。
AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对比了强直性脊柱炎患者与健康人的粪便菌群组成差异,并发现患者粪便中潜在的交叉反应性细菌表位的富集,同时,抗TNF改善与患者菌群的恢复、交叉性细菌表位的减少相关。①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。这种检测方法对于评估肠道菌群失衡导致的各种疾病,以及评估人体对各种手段的反应具有重要意义。江苏神经类疾病菌群检测常用方法
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强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化:①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。江苏神经类疾病菌群检测常用方法