北京冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

当在完整状态下进行分析时，EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可以有效地去除 N 糖（含有PNGase F酶）和 O-糖，如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖，因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议（在37°C下进行O/N孵育），两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理，并显示数据以供比较。另一方面，N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近，或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态，就根本无法接近。因此，这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。GalactEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalactEXO酶。北京冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

genvois的OpeRATOR 是一种内切蛋白酶，可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽键的水解。内切蛋白酶具有高特异性，可消化丝氨酸或苏氨酸残基的O-聚糖N端的蛋白质。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖，并且该酶不会用 N-连接聚糖消化糖蛋白。该酶对具有亚洲化he心1 O-聚糖的位点z活跃。它还消化唾液酸化的he心 1 和he心 3，但程度要低得多。为了获得z佳性能，需要去除唾液酸，因此，SialEXO冻干（唾液酸酶混合物）包含在购买中。 北京冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发GalNAcEXO酶是可降低样品异质性，用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。

为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性，将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时，OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品，以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化：O-糖基化生物制药（如依那西普）很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数，我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。

在这里，Genovis分析了 C1 抑制剂——一种人血浆衍生的生物zhiliao药物，由 6 种 N-聚糖和多达 28 种 O-聚糖修饰，主要由唾液酸he心 1 结构组成。在不对这种高度异质的蛋白质进行任何预处理的情况下，反相LC-MS分析产生了无法详细解释的复杂质谱图。在天然条件下使用OmniGLYZOR Microspin色谱柱，可在3小时内有效去除所有O-聚糖。然而，蛋白质上仍残留着 1 到 3 个 N-聚糖。使用冻干的PNGase F和OmniGLYZOR试剂盒中包含的MS友好型RapiGest™ SF表面活性剂*，在变性条件下通过额外的去糖基化步骤去除这些不可接近的N-聚糖。观察到所有聚糖的完全去除，但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不会从变性中获益，这就是为什么OmniGLYZOR Microspin色谱柱只能在非变性条件下使用的原因。使用FabRICATOR®将曲妥珠单抗消化成亚基，并使用LC-MS进行分析。

Genovis的PNGase F（肽 N-糖苷酶 F）是一种糖酰胺酶，可水解多肽天冬酰胺与所有哺乳动物天冬酰胺连接复合物、杂交或高甘露糖寡糖的内层 GlcNAc 之间的酰胺键。该酶用于MS分析前的样品制备，以降低蛋白质异质性并实现游离的聚糖分析，并研究N-聚糖的功能作用。1. 对所有哺乳动物N-聚糖的高效水解；2.对多种糖蛋白具有活性；3.可固定在即用型离心柱产品形式；4. 自动化友好型，96孔板，用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一种 O-糖依赖性蛋白酶，可消化携带粘蛋白型。O-聚糖的蛋白质，包括唾液酸化物质、糖基化丝氨酸和 Thr 残基的 N-末端。该酶产生携带 O-糖的糖肽，从而实现 O-糖谱分析、位点占用测定和 O-糖肽图谱以及使用 LC-MS 分析的中级方法。1. 特异性广 - 接受多种 O-聚糖变体，包括唾液酸化物种；2. 可靠O-聚糖特异性蛋白酶 – 消化丝氨酸/苏氨酸糖基化位点的 N 末端；3. 稳健的消化，增强复杂生物制药的表征。SialEXO在天然条件下水解糖蛋白，在pH值范围为6.5至9时显示出活性。北京冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

采用合适的酶策略来去除这些GalNAc并简化生物制药的表征。北京冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 （EPO） 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质，其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置，因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。北京冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发