当在完整状态下进行分析时,EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖,因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议(在37°C下进行O/N孵育),两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理,并显示数据以供比较。另一方面,N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态,就根本无法接近。因此,这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。使用OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析。四川固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
Core 1型O-聚糖的水解:O-糖基化不仅难以研究,其自然异质性也会导致其他分析出现问题。例如,由于样品中存在许多不同的糖型,因此对完整或中等水平的重糖基化蛋白质进行质谱分析可能非常困难。酶法去除N-聚糖的解决方案已经存在多年,Genvois的PNGase F是一种非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑战性,现有的O-糖释放化学方法通常会导致蛋白质发生重大修饰,因此不太适合下游分析。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。四川固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发FucosEXO 是α-岩藻糖苷酶混合物。
我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 (EPO) 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质,其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。
与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖:糖基化往往是异质的,这使得对高度糖基化的生物zhiliao药物的分析具有挑战性。完整质量数的确认以及其他产品质量属性的表征受到不同糖型复杂性的阻碍,这就是为什么有效的聚糖去除工具简化了此类分析的原因。 虽然 N-聚糖包含一个共同的结构,并且可以通过 PNGase F 整体去除,但粘蛋白型 O-聚糖在结构上更加多样化,具有多个不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物,能够依次分解O-聚糖,以完全去除最常见的O-聚糖结构(二唾液酸和单唾液酸基he心1和Tn抗原)。复杂样品的特异性净化;改进 MS 分析的样品制备。
用于水解离心柱中糖蛋白上的N-聚糖的固定化酶。 Genovis的PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶,用于在样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。 将糖蛋白样品与PNGase F一起在离心柱中固定,然后通过离心步骤轻松收集去糖基化的蛋白质。由于空间位阻,PNGase F对某些糖蛋白的活性可能缓慢或受到抑制 - 在这些情况下可能需要更长的孵育时间或糖蛋白变性。 Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.2 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3.z终样品中的酶峰减少。ImpaRATOR 是一种 O-糖依赖性蛋白酶,可消化携带粘蛋白型O-聚糖的蛋白。河北固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
OmniGLYZOR特点:与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进蛋白的分析;四川固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
genovis的FucosEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性,使其与大多数样品相容。此外,FucosEXO活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子,如BSA。根据底物的性质,FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 连接的岩藻糖残基,而对于非常复杂的样品可能需要更长的孵育时间。FucoseEXO也可固定在离心柱中,可快速方便地处理高达0.5mg的糖蛋白。使用离心柱形式,将糖蛋白样品与固定化的FucosEXO树脂一起孵育,然后在离心步骤中轻松收集消化的糖蛋白。四川固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发