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湖北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

来源: 发布时间:2024年09月11日

使用Genovis的GalNAcEXO 对 O-糖基化生物制药进行 Tn 抗原表征:未成熟的截短O-聚糖导致了复杂生物制药的异质性,使其分析更具挑战性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc残基组成,通过糖苷键与丝氨酸或苏氨酸连接,称为Tn抗原。 现在,使用GalNAcEXO可以采用合适的酶策略来去除这些GalNAc并简化生物制药的表征。在质谱图中可以观察到重复峰的模式。其次,在与GalNAcEXO酶孵育后,剩余的GalNAc残基被完全去除,留下一个峰。因此,该工作流程确认了 O-糖基化生物制药上存在 Tn 抗原,并允许定量he心 GalNAc 水平。这种工作流程的另一个好处是减少了剩余的异质性,这有助于确认蛋白质的完整质量,并揭示截短的片段。SialEXO用于OpeRATOR或OglyZOR消化前预处理O-糖基化蛋白。湖北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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用于水解β1-3,4-连接半乳糖的固定化酶在离心柱中的糖蛋白上。Genovis的GalactEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalactEXO酶,用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解,而不会用酶污染z终制剂。Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. z终样品中不含酶。GalactEXO 酶来源于 Akkermansia muciniphila 并重组表达,可有效水解 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖。GalactEXO微离心柱经过格式化,可在30-60分钟内水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。重庆N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究ImpaRATOR酶产生携带 O-糖的糖肽。

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我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 (EPO) 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质,其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。

SialEXO 2-3 在天然条件下水解糖蛋白,在 pH 值范围为 7.0 至 9.0 时显示出活性。该酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。该酶具有 His 标签,分子量为 66 kDa。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高用于离心柱中糖蛋白去唾液酸化的固定化酶。Genovis的SialEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的SialEXO酶,用于糖蛋白的去唾液酸化,而不会被酶污染z终制剂。它水解天然糖蛋白上的唾液酸(α2-3、α2-6 和 α2-8)并释放出聚糖。效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖结构表征。

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GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。GalactEXO由两种半乳糖苷酶组成,均带有His标签,组分的分子量为87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的冻干酶。Genovis的GalactEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 2000 单位小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-连接的半乳糖。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率; 3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可!将混合物加载到GlycOCATCH上,洗涤树脂,并用8M尿素洗脱结合的肽。纯化后,在RP-LC-MS上分离样品。数据显示,糖苷酸肽的选择性纯化,携带he心1-O-聚糖。IgA 特异性 O-糖肽富集:IgA 抗体包含 N-连接的糖基化和重度 O-糖基化的铰链区域。胰蛋白酶消化IgA后,将肽和genovis 的SialEXO的混合物加载到GlycOCATCH树脂上,并用PBS和离心洗涤。用 8 M 尿素洗脱显示预期的 O-糖基化铰链肽富集,具有不同程度的糖基化。因此,其水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。浙江PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物可快速有效地去除抗体、融合蛋白;湖北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

我们测量了FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO可有效释放α1-2、α1-3和α1-4连接的岩藻糖,对α1-6连接的岩藻糖残基没有活Genovis的FucosEXO的底物特异性:岩藻糖以不同的键存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖常见于 O-聚糖中,并作为 N-聚糖的天线岩藻糖基化,而 α1-6 连接的岩藻糖被发现是 N-聚糖he心的修饰。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一种β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-连接末端半乳糖。湖北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究