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天津PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

来源: 发布时间:2024年08月12日

GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。GalactEXO由两种半乳糖苷酶组成,均带有His标签,组分的分子量为87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的冻干酶。Genovis的GalactEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 2000 单位小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-连接的半乳糖。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率; 3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可!将混合物加载到GlycOCATCH上,洗涤树脂,并用8M尿素洗脱结合的肽。纯化后,在RP-LC-MS上分离样品。数据显示,糖苷酸肽的选择性纯化,携带he心1-O-聚糖。IgA 特异性 O-糖肽富集:IgA 抗体包含 N-连接的糖基化和重度 O-糖基化的铰链区域。胰蛋白酶消化IgA后,将肽和genovis 的SialEXO的混合物加载到GlycOCATCH树脂上,并用PBS和离心洗涤。用 8 M 尿素洗脱显示预期的 O-糖基化铰链肽富集,具有不同程度的糖基化。依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖。天津PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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对Genovis的ImpaRATOR处理的样品的分析表明,ImpaRATOR很好地消化了所有三种底物并产生了相似的糖肽,但预期的聚糖种类不同。用ImpaRATOR处理的样品比其他样品含有更多的变异,因为每种肽都检测到多种聚糖结构。观察到的聚糖种类主要是单唾液酸化和二唾液酸化he心1结构,这与依那西普的预期一致。用ImpaRATOR或OpeRATOR消化的SialEXO预处理样品均产生具有裸核1结构的肽,但携带在ImpaRATOR消化样品中观察到的Tn抗原的肽T205-P207除外。依那西普用 SialEXO 和 GalactEXO 预处理,然后用 ImpaRATOR 消化,得到含有 Tn 抗原的肽。总之,这些数据证明了ImpaRATOR的高聚糖底物接受度。ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。例如,OpeRATOR在两个O-糖基化氨基酸之间消化的效率比ImpaRATOR更有效。具有完整唾液酸或Tn抗原的依那西普被OpeRATOR消化得非常弱(数据未显示)。天津PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。

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在抗体药物及核酸药物领域,倍笃生物产品线涵盖药物研发的全流程,主要用——RNA转染试剂、生物活性物质纯化分离用填料产品、ADC的payload抗体(如anti-DXD、anti-Eribulin、anti-MMAE等)、动物造模用阳性及阴性抗体、泊洛沙姆P 188 Bio、工艺杂质及外源污染物残留检测产品、抗体结构域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶等,品牌有瑞典Genovis、德国BASF、美国QED、中国君研生物、中国金传生物、中国毫厘科技、中国再帆生物等。这些国产品牌都具有国内自研、自产能力,批次生产稳定可靠、品质可控,为行业发展提供更多国产选择。

C1抑制剂的去糖基化:在O-糖基化生物制药的生产过程中,由于he心GalNAc残基的加工不完全,可能会出现Tn抗原。这表现为具有 203 Da HexNAc 单位差异的重复质量位移。为了确认 Tn 抗原的存在,可以应用以下工作流程,此处在重度(26 个位点)O-糖基化 C1 抑制剂上演示。首先,使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖,使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能测试 :依那西普是另一种具有挑战性的生物制药模型分子,携带 13 个 O-聚糖位点,其中平均 9 至 10 个位点被占用。FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 。

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ImpaRATOR 是一种 O-聚糖依赖性蛋白酶,可催化糖蛋白和糖肽中与糖基化丝氨酸或苏氨酸残基相邻的肽键的水解。它切割用粘蛋白型O-聚糖修饰的丝氨酸或苏氨酸残基的N-末端,包括唾液酸化物种。粘蛋白型O-聚糖是ImpaRAT活性所必需的,该酶不会消化未修饰的丝氨酸或苏氨酸残基,也不会在糖蛋白的N-糖基化位点。该酶接受 O-聚糖结构,包括唾液酸化he心 1 和he心 2 结构以及 Tn 抗原。Genovis的ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 97 kDa。OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖。天津PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为52 kDa。天津PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物,用于有效水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接岩藻糖残基。它是 N-和 O-糖蛋白的聚糖结构分析以及寡糖的外切糖苷酶阵列的宝贵工具。1. 高效α-岩藻糖苷酶混合物 – 快速去除 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接的岩藻糖;2. 可靠的酶解增加了对外切糖苷酶阵列的信心;3. 可固定在即用型离心柱中。用于糖蛋白去氟糖基化的冻干酶。Genovis的FucosEXO冻干剂以冻干粉的形式提供,装在2000单位的小瓶中,用于2mg糖蛋白的去碳基化。天津PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究