GlycOCATCH设计用于特异性结合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。亲和树脂基于无活性的Genovis的OpeRATOR酶,该酶经过工程设计,可以高亲和力结合O-糖基化蛋白和肽。 结合在pH 5-8的生理缓冲液中进行。由于GlycOCATCH树脂和O-糖蛋白/肽之间的强相互作用,可以用8M尿素进行洗脱。或者,可以使用活性OpeRATOR酶进行洗脱,该酶消化O-聚糖位点的N末端结合的O-糖蛋白。在后一种情况下,肽在天然条件下回收。OpeRATOR 冻干酶包含在购买中。由于 O-糖蛋白上的旋亚氨酸化 O-聚糖与树脂结合效率更高,因此唾液酸酶混合物 SialEXO 冻干也包含在购买中。GalNAcEXO酶是可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。辽宁固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
由于蛋白质的O-糖模式的异质性和O-糖结构的OpeRATOR特异性,形成了重叠的肽,从而可以获得O-糖位点的完整图谱为了进行比较,相同材料的标准胰蛋白酶消化物, 显示难以分析的少量且非常大的糖肽。使用Genovis的OpeRATOR进行O-糖位点定位:OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶,可消化丝氨酸和苏氨酸糖基化位点的粘蛋白型 O-糖蛋白 N 端。这会产生携带O-糖的糖肽,并能够使用质谱法进行O-糖分析、O-糖肽图谱以及中级分析。下面是OpeRATOR消解位点的示意图。辽宁固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发使用 GalNAcEXO 对 O-糖基化生物制药进行 Tn 抗原表征。
水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效;与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进基础蛋白的分析;固定形式可提高酶与底物的比率,从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州,美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。
从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖:Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性,这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中,例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟,并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解,这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解,而不会用酶污染z终制剂。
GalNAcEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalNAcEXO酶,用于水解糖蛋白上的GalNAc残基,而不会用酶污染制剂。Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. 终样品中不含酶。用于水解离心柱中糖蛋白上的Genovis的GalNAc残基的固定化酶。GalNAcEXO 酶是一种n 外α-N-乙酰半乳糖氨酸酶,可快速有效地水解来自天然 O-糖蛋白的 z es GalNAc 残基。 该酶来源于Akkermansia muciniphila,在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为52 kDa。 该酶在 Tn 抗原和 α1-3 连接末端 GalNAcs 上均显示活性。在这里,我们展示了如何使用GalNAcEXO来表征复杂的生物制药。两种酶都含有 His 标签,酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。辽宁固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
GalactEXO微离心柱经过格式化,可在30-60分钟内水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。辽宁固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物,可快速有效地去除抗体、融合蛋白和其他糖基化蛋白上的 N 和简单的粘蛋白型 O-聚糖。聚糖的去除被用于减少异质性,以促进蛋白质的分析,例如质谱法。去糖基化也可用于研究聚糖的功能作用。N-和粘蛋白型O-连接聚糖的快速高效去糖基化;即用型离心柱形式 - 无酶干扰分析;与LC-MS兼容。与PNGase F类似,Genvois的与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 含有去除 N-糖和最常见的粘蛋白型 O-糖所需的酶,即单唾液酸和二唾液酸he心 1 和 Tn 抗原 (α-GalNAc)。OmniGLYZOR Microspin 小柱中包含以下组分:PNGase F;O-糖苷酶。辽宁固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发