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湖北瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

来源: 发布时间:2024年07月03日

Core 1型O-聚糖的水解:O-糖基化不仅难以研究,其自然异质性也会导致其他分析出现问题。例如,由于样品中存在许多不同的糖型,因此对完整或中等水平的重糖基化蛋白质进行质谱分析可能非常困难。酶法去除N-聚糖的解决方案已经存在多年,Genvois的PNGase F是一种非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑战性,现有的O-糖释放化学方法通常会导致蛋白质发生重大修饰,因此不太适合下游分析。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖。湖北瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR用于携带N-和简单O-糖的糖蛋白的去糖基化。 OmniGLYZOR 试剂盒包括:OmniGlyZOR 微离心柱;PNGase F 冻干;RapiGest™* SF表面活性剂。除非底物蛋白变性,否则某些 N-糖基化位点很难或无法被 PNGase F 接近。在OmniGLYZOR Microspin柱上孵育后剩余的N-糖可以在变性条件下使用试剂盒中包含的PNGase F冻干和RapiGest™ SF表面活性剂通过额外的去糖基化步骤去除。使用Genovis的OpeRAT对EPO进行O-糖位点特异性消化:对于jin携带一个或几个 O-糖基化位点的简单底物蛋白,OpeRATOR 也可用于绘制中间水平的 O-糖基化位点。 湖南用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与 GlycOCATCH 一起孵育:洗脱O-糖基化蛋白。

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Genovis的GlycOCATCH®是一种亲和树脂,可特异性结合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,从而实现简单的工作流程,以富集和纯化携带O-聚糖的蛋白质和肽。洗涤离心柱,并用8M尿素洗脱结合的蛋白质。对洗脱材料的分析表明,由于洗脱O-糖基化蛋白,并且树脂与非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的结合可以忽略不计。选择性结合 O-糖蛋白:为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。为了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特异性,将O-glcyosyled肽(糖蛋白)与一系列未修饰的肽混合。

水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效;与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进基础蛋白的分析;固定形式可提高酶与底物的比率,从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州,美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。GalNAcEXO酶是可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。

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与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖:糖基化往往是异质的,这使得对高度糖基化的生物zhiliao药物的分析具有挑战性。完整质量数的确认以及其他产品质量属性的表征受到不同糖型复杂性的阻碍,这就是为什么有效的聚糖去除工具简化了此类分析的原因。 虽然 N-聚糖包含一个共同的结构,并且可以通过 PNGase F 整体去除,但粘蛋白型 O-聚糖在结构上更加多样化,具有多个不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物,能够依次分解O-聚糖,以完全去除最常见的O-聚糖结构(二唾液酸和单唾液酸基he心1和Tn抗原)。PNGase F Automation 含有以自动化友好的 96 孔板形式冻干的 PNGase F 酶。湖北PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

GlycOCATCH®用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法:靶向 O-糖蛋白富集;湖北瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

α连接的Genovis的GalNAcs的水解:GalNAcEXO 是一种 α-N-乙酰半乳糖胺苷酶,可有效水解糖蛋白上的末端 GalNAc 残基。与丝氨酸或苏氨酸连接的 GalNAc(称为 Tn 抗原)被 GalNAcEXO 快速有效地水解,并且该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAcs 上显示出活性。Genovis的GalNAcEXO 是一种外α-N-乙酰半乳糖胺酶,用于有效水解与糖蛋白(Tn 抗原)中的丝氨酸或苏氨酸残基相连的 α-N-乙酰半乳糖胺 (GalNAc)。该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAc 上显示活性。GalNAcEXO 在天然条件下水解糖蛋白上的 GalNAc,在 pH 值 6.0 至 7.6 范围内具有高度活性。湖北瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究