Genovis将固定化酶固定在磁珠上,用于在铰链下方自动消化IgG。FabRICATOR(IdeS)是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶,可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体,产生均质的F(ab')2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。这些微球能够在中级表征工作流程中并行快速自动酶解多种抗体。它们专为自动化平台而设计,但在无法实现自动化的情况下,在振动台上的表现同样出色。酶切消解后,样品可直接转移到LC-MS的自动进样器进行快速色谱分析,或转移到其他分析方法进行分析。自动平行抗体酶切和亚基生成允许处理与克隆选择、工艺开发和潜在生物制药稳定性研究相关的大量样品。自动抗体亚基分析可减少操作人员的时间和样品处理错误的风险,并提高通量。Genovis的FabRICATOR MagIC酶解mAb,使用LC-MS进行中级分析。陕西GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切
为什么客户想在他们的工作试用Genovis的FabRICATOR(IdeS)。FabRICATOR的高特异性(在铰链下方有单个消化位点)以及它对IgG种和亚类表现出活性的事实使其成为高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大优势是速度。在大多数IgG上,您可以在短短30分钟内生成F(ab’)2和Fc/2片段,这一速度简化了方法开发,并允许快速有效的中层表征,使客户能够在不比做完整质量实验长太多的时间内获得更多关于分子的信息。Genovis发现更多的缓冲液与溶液中的FabRICATOR消解相容(更多信息)。Genovis已经测试了PBS和150mM醋酸铵,pH7,结果良好。并且应该也适用于FabRICATORHPLC。然而,缓冲液的离子强度会影响抗体片段在FabRICATORHPLC(IdeS)色谱柱上的保留,并且IgG1亚基需要至少100-150mM盐才能洗脱为单个窄峰。其他IgG亚类或融合蛋白可能需要对缓冲液组成进行一些优化。江西GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学Genovis将固定化酶固定在磁珠上,用于在铰链下方自动消化 IgG。
Genovis的FabRICATOR(IdeS)酶 可用于 IgG 的所有人类亚类以及人源化和嵌合 IgG。该酶对其他物种的 IgG 也有活性,包括来自大鼠、猴子、兔子和绵羊的某些类别的 IgG。因此,FabRICATOR的高特异性在某些情况下会使其对铰链区域的突变敏感,并损害酶活性。来自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成,与 FabRICATOR 相比,FabRICATOR Z 在消化这些 IgG 方面具有更高的效率。然而,小鼠 IgG1 在铰链下方具有不同的序列,并且不被 FabRICATOR Z 消化。对于这种抗体种类,FabULOUS 和 FabULOUS Fab 试剂盒可用于制备 Fab 片段。
蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。FabRICATOR(IdeS)酶是生物制药行业中普遍使用的工具。
与肽图谱相比,根据Genovis科学家的经验,尤其是对于像抗体这样的分子,许多人在常规实验中做了太多的肽图谱,而中级水平(Middle-level)的方法可以很好地工作。中级方法(IdeS酶切抗体)需要更少的实际操作步骤和较少的示例处理,所有这些都意味着过程中出错的事情更少。我们的许多酶可以作为平台方法,同样的方法适用于绝大多数的抗体,这不是肽图的情况下,可能需要优化整个样品制备,LC分离,质谱设置和数据分析的每个不同的抗体分析。这些变化可能是很小的,但没有一种适用于所有肽图的方法。由于分析和数据分析的简单性,中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。肽图当然可以自动用于样品制备,但高通量肽图生成大量数据,仍然需要彻底分析。事实上,肽图谱是一个多步骤的过程,每一个步骤都可能破坏方法,并可能导致破坏蛋白质的人工制品,很难交叉训练给非专业人员。中级水平的方法很容易交叉训练,我们的方法在质量控制实验室中被成功地使用。肽图谱是一种用于修饰分析和氨基酸确认的方法,但一旦完成了这一工作,我相信使用中级分析可以成功地更有效地完成抗体样本的大部分工作。发现GingisREX精氨酸残基的特异性,Arg-C在赖氨酸和其他残基的非特异性。陕西GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切
反相LC-MS对样品的分析表明,使用Genovis的GlySERIAS进行度拉糖肽的连接子消化后,肽从Fc区域完全去除。陕西GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切
与IdeS不同,Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶,可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子,例如Gly4Ser和GlyxSery(GS)以及聚甘氨酸(G)接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域,以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性,又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除,Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征,我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白;中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性;复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性,能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化,导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下,孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的,在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为18kDa。陕西GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切