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海南GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学

来源: 发布时间:2024年05月09日

Blinatumomab(一种对 CD19 和 T 细胞标志物 CD3 具有特异性的 BiTE 分子)的研究级生物仿制药在室温下用固定化过夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通过LC-MS对消解样品的直接分析表明,所有三个连接子区域均被消解,α-CD3 VL和VH链洗脱为一个色谱峰,α-CD19 VH和VL链作为单独的峰洗脱。来自连接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 结构域的小峰显示该短连接子未完全消化,表明 GlySERIAS 对短连接子的活性较低。与完整的蛋白质分析相比,四个结构域的分离提供了具有单同位素分辨率的高质量光谱。可以观察到每个结构域的几个不同变体,剩余的连接子残基数量不同。在色谱分离过程中,α-CD3 VH结构域无法从α-CD19 VH结构域完全基线分离,导致在相关质谱中观察到一些共洗脱。四个结构域的分离产生了有关在完整蛋白质水平上鉴定的蛋白质修饰位置的信息。例如,在完整水平上鉴定的 37 Da 的蛋白质修饰被分配给 α-CD3 VH 链。此外,240Da 和 320da 的两个修饰分别被分配给 α-CD3 VL 结构域。后者还含有一个带有五六个组氨酸残基的 His 标签。这些数据证明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 对包含多个柔性连接子蛋白进行质量控制的中级工作流程的强大功能。生成完整的 Fab片段或从依那西普上的融合TNFR结构域中分离 Fc。海南GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学

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蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。海南GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体,产生均质的 F(ab')2 和 Fc 片段。

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抗体的氧化是可能影响抗体功能的关键质量属性,需要密切定量和表征。它可能导致mAb的体内半衰期、功效和稳定性降低。Genovis的FabRICATOR(IdeS)消化产生的抗体亚基是研究抗体氧化的理想选择。酶解的稳健性允许在受监管的环境中监测抗体亚基氧化。Genovis的FabRICATOR(IdeS)是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶,可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体,产生均质的F(ab')2和Fc片段。该酶用于基于抗体的疗法(如mAb、ADC、生物类似药和Fc融合蛋白)的表征、质量控制、稳定性测试、生产监测和克隆选择。高度特异性-铰链下方的一个消化位点快速–在30分钟内生成均匀的片段池实现基于抗体的生物zhiliao药物的表征和质量控制可固定在即用型离心柱中

与IdeS不同,融合蛋白是通过将两种或多种蛋白质或肽的功能组合成一个量身定制的分子来创造的,以专门应对挑战。连接此类蛋白质或肽结构域的常见方法是包含柔性连接子。这些连接子通常富含甘氨酸,例如甘氨酸残基(G),或甘氨酸残基散布丝氨酸残基(GS)以形成重复序列。这为连接子提供了足够的灵活性,不会干扰连接蛋白质结构域的功能。然而,这些新模式带来了新的分析挑战,需要新的工具来促进表征和产品质量监测。中级分析已成为分析单克隆抗体疗法的标准方法,涉及将分子消化成几个定义的亚基。它们足够小,可以获得高质量的质谱图,并为产品质量属性提供特定领域的信息。由于G和GS连接子对常见蛋白酶的降解具有抗性,因此很难分离结构域以进行深入分析。因此,Genovis开发了GlySERIAS,不同于IdeS酶,一种消化柔性富含甘氨酸的连接子的酶。GlySERIAS可以分离不同的功能域,并实现对融合蛋白、多特异性抗体和含有富含甘氨酸的连接子的各种mAb片段进行详细表征的中级方法。有助于监测多种CQA,例如糖基化、氧化和C端赖氨酸剪切。

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Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR(IdeS),为客户提供了许多选择,以满足他们的需求。 冻干形式用于高度灵活的方法开发的目的,并随时准备使用,只需重组和添加到IgG样本。 冻干酶的灵活性也意味着它可以应用于更高的通量和自动化的工作流程。 Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶,在随时可用的旋转柱中,这可以极大限度地减少在样品中残留的酶,这可能是有利的。 对于更多的制备应用,我们提供FabRICATOR Fab2试剂盒,这是IgG片段生成和纯化的强大工具。 这包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc纯化柱,用于亚基的亲和纯化。 由于FabRICATOR在非还原条件下是活性的,F(ab’)2片段保留其链间和链内二硫键,如果片段想用于结合研究,这一点尤为重要,因为结合效率和免疫反应性将被保留。单一酶切位点和质谱的精度确保了Fc糖基化谱检测,用于监测批次间的一致性和其他关键质量属性。海南GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学

剩下一个连接子残基(甘氨酸残基),这有助于识别位于Fc区域的修饰。海南GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学

作为免疫系统的重要组成部分,IgA在自身免疫性疾病、过敏反应、胃肠道疾病等许多不同的健康状况中发挥作用。在天然条件和复杂生物样品中选择性和特异性消化IgA的能力在临床医学和研究中具有重要价值。IgASAP酶是降低zhiliao性IgA候选物样品复杂性并简化IgA分析表征的宝贵工具。人IgA1和IgA2之间的一个显着结构差异是铰链区域。与IgA2相比,IgA1具有更长的富含O-聚糖且更灵活的铰链区域。IgASAPSub1的消化位点位于该扩展区域,使酶具有IgA1特异性。IgA2亚类以三种等位基因形式存在,A2m1、A2m2和A2m3。IgASAPSub1+2在脯氨酸(P)和缬氨酸(V)之间消化IgA1和IgA2m1只有N端到铰链区域,但由于A2m2和A2m3中的脯氨酸残基被精氨酸(R)残基取代,因此这两种同种异体型的IgA2对消化具有抗性。海南GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学