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甘肃FabRICATORIdeS蛋白酶

来源: 发布时间:2024年05月08日

蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。能够在中级表征中并行快速自动酶解多种抗体。甘肃FabRICATORIdeS蛋白酶

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为了让所有实验室都能同时快速自动消化多种抗体,Genovis的FabRICATORMagIC的设计具有灵活性,适用于一系列自动化平台。我们在ThermoScientific™KingFisher™纯化系统上优化了FabRICATORMagIC的工作流程,但它可以转移到其他自动化平台,如果没有自动化,在振动台上也能同样出色地工作。消解后,将含有处理样品的深孔板直接转移到LC-MS的自动进样器中进行快速色谱分析,或转移到其他分析方法进行分析。FabRICATORMagIC与在消解缓冲液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容,以极大限度地减少自动化系统中可能发生的纯粹压力。使用KingFisher仪器处理样品时,样品制备非常简单。将样品、树脂和缓冲液移液到指定的孔或板中,然后将板放入仪器中。设计用于FabRICATORMagIC的BindIt™协议将控制每个步骤的孵育温度和时间。湖北FabRICATORIdeS蛋白酶FabDELLO 是从 Bdellovibrio 细菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 32 kDa。

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作为免疫系统的重要组成部分,IgA在自身免疫性疾病、过敏反应、胃肠道疾病等许多不同的健康状况中发挥作用。在天然条件和复杂生物样品中选择性和特异性消化IgA的能力在临床医学和研究中具有重要价值。IgASAP酶是降低zhiliao性IgA候选物样品复杂性并简化IgA分析表征的宝贵工具。人IgA1和IgA2之间的一个显着结构差异是铰链区域。与IgA2相比,IgA1具有更长的富含O-聚糖且更灵活的铰链区域。IgASAPSub1的消化位点位于该扩展区域,使酶具有IgA1特异性。IgA2亚类以三种等位基因形式存在,A2m1、A2m2和A2m3。IgASAPSub1+2在脯氨酸(P)和缬氨酸(V)之间消化IgA1和IgA2m1只有N端到铰链区域,但由于A2m2和A2m3中的脯氨酸残基被精氨酸(R)残基取代,因此这两种同种异体型的IgA2对消化具有抗性。

抗体 Fc 糖基化谱是一种重要的 CQA,因为它会影响疗效、和免疫原性。因此,需要从早期开发、工艺开发到质量控制和批量放行的整个过程对Fc聚糖谱进行监测。传统的分析方法基于对游离的聚糖进行荧光标记,然后通过HILIC-HPLC或CE进行分析,这需要多步骤的样品制备方案,这需要大量的时间和资源。使用Genovis的FabRICATOR MagIC酶解mAb,然后使用LC-MS进行中级分析,为Fc聚糖分析提供了一种快速、直接的替代方法。如上所示,它很容易实现自动化,以提高通量并降低处理错误的风险。度拉糖肽的连接子中的大量甘氨酸残基为GlySERIAS提供了许多不同的潜在消化位点。

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与肽图谱相比,根据Genovis科学家的经验,尤其是对于像抗体这样的分子,许多人在常规实验中做了太多的肽图谱,而中级水平(Middle-level)的方法可以很好地工作。中级方法(IdeS酶切抗体)需要更少的实际操作步骤和较少的示例处理,所有这些都意味着过程中出错的事情更少。我们的许多酶可以作为平台方法,同样的方法适用于绝大多数的抗体,这不是肽图的情况下,可能需要优化整个样品制备,LC分离,质谱设置和数据分析的每个不同的抗体分析。这些变化可能是很小的,但没有一种适用于所有肽图的方法。由于分析和数据分析的简单性,中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。肽图当然可以自动用于样品制备,但高通量肽图生成大量数据,仍然需要彻底分析。事实上,肽图谱是一个多步骤的过程,每一个步骤都可能破坏方法,并可能导致破坏蛋白质的人工制品,很难交叉训练给非专业人员。中级水平的方法很容易交叉训练,我们的方法在质量控制实验室中被成功地使用。肽图谱是一种用于修饰分析和氨基酸确认的方法,但一旦完成了这一工作,我相信使用中级分析可以成功地更有效地完成抗体样本的大部分工作。降低样品处理错误的风险,同时提高通量。湖北FabDELLOIdeS蛋白酶抗体酶切

Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶,在随时可用的离心柱中,这可以大限度地减少在样品中残留的酶。甘肃FabRICATORIdeS蛋白酶

Genovis提供具有低水平内Du素的FabRICATOR(IdeS)冻干酶,用于IgG的铰链以下消化。FabRICATOR(IdeS)是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶,可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体,产生均质的F(ab')2和Fc片段。FabRICATORLowEndotoxin以冻干粉的形式提供两种不同规格:2000和5000单位,分别用于消化2mg或5mgIgG。该产品配方每瓶的内Du素含量较低,2000单位小瓶的内Du素含量为<0.04EU/瓶,5000单位小瓶的内Du素含量为<0.10EU/瓶。有效消化,内DU素水平低;适用于灵敏的体内或基于细胞的检测。甘肃FabRICATORIdeS蛋白酶