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浙江IgGZEROIdeS蛋白酶蛋白组学

来源: 发布时间:2024年04月24日

与IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一种精氨酸特异性蛋白酶,可消化精氨酸残基的C末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化;在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶,可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基,包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽,胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择,以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性,通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性,它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。小鼠 IgG1 在铰链下方具有不同的序列,不被 FabRICATOR Z 消化。浙江IgGZEROIdeS蛋白酶蛋白组学

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Genovis的FabRICATOR Fab2 (IdeS)试剂盒可消化兔 IgG,但要在亲和步骤中捕获 Fc 片段,您需要另一种填料,而不是试剂盒中通常包含的 CaptureSelect™ Fc。如果您对处理兔IgG感兴趣,请联系Genovis团队,我们将在FabRICATOR Fab2试剂盒中提供与兔Fc相容的树脂色谱柱。使用FabRICATOR的抗体消化的简单性、速度和可重复性也意味着这种酶可以被用于质量控制应用。 QC方法需要执行简单,易于训练,高度可重复,数据易于分析,这正是您使用FabRICATOR所得到的。 因为它适用于一系列不同的IgG,这也意味着使用FabRICATOR进行QC工作的客户将能够在未来的产品中使用它。 这显示了这种酶在抗体消化中是多么的有效。湖南FabULOUSIdeS蛋白酶反相LC-MS对样品的分析表明,使用Genovis的GlySERIAS进行度拉糖肽的连接子消化后,肽从Fc区域完全去除。

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与IdeS不同,Genovis的FabULOUS(SpeB)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在来自多个不同物种和亚类的IgG的铰链区域消化,产生Fab和Fc片段。人、小鼠、大鼠、山羊和绵羊的IgG被FabULOUS消化,产生Fab和Fc片段。人IgG1的主要消化位点是......KTHT...例如,制备的Fab片段可用于亲和力研究、Fab糖基化研究和结构研究。对来自多个物种和亚类的IgG有活性–上铰链区域的消化物;快速-在一小时内生成Fab和Fc片段;有效消化小鼠IgG1。FabULOUS来源于化脓性链球菌,在大肠杆菌中表达。FabULOUS的分子量为29kDa,该酶含有His标签。

蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。Genovis亚基分析比肽图谱具有简单快速的巨大优势,更适用于高通量的检测,并可用于支持肽图分析。

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Blinatumomab(一种对 CD19 和 T 细胞标志物 CD3 具有特异性的 BiTE 分子)的研究级生物仿制药在室温下用固定化过夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通过LC-MS对消解样品的直接分析表明,所有三个连接子区域均被消解,α-CD3 VL和VH链洗脱为一个色谱峰,α-CD19 VH和VL链作为单独的峰洗脱。来自连接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 结构域的小峰显示该短连接子未完全消化,表明 GlySERIAS 对短连接子的活性较低。与完整的蛋白质分析相比,四个结构域的分离提供了具有单同位素分辨率的高质量光谱。可以观察到每个结构域的几个不同变体,剩余的连接子残基数量不同。在色谱分离过程中,α-CD3 VH结构域无法从α-CD19 VH结构域完全基线分离,导致在相关质谱中观察到一些共洗脱。四个结构域的分离产生了有关在完整蛋白质水平上鉴定的蛋白质修饰位置的信息。例如,在完整水平上鉴定的 37 Da 的蛋白质修饰被分配给 α-CD3 VH 链。此外,240Da 和 320da 的两个修饰分别被分配给 α-CD3 VL 结构域。后者还含有一个带有五六个组氨酸残基的 His 标签。这些数据证明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 对包含多个柔性连接子蛋白进行质量控制的中级工作流程的强大功能。FabRICATOR Magic磁珠化IdeS酶切的自动抗体亚基分析可减少操作人员的时间和样品处理错误的风险。上海GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学

这正是您使用FabRICATOR(IdeS蛋白酶)可以得到的。浙江IgGZEROIdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis除了提供IdeS酶以外,还提供很多种特异性蛋白酶,如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA (IgdE)。IgdE 在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1,产生完整的 Fab 和 Fc 片段的均质池。它在pH值和盐浓度范围内具有活性,不需要任何还原剂或辅助因子。因此,与许多其他常用的蛋白酶相比,FabALACTICA不需要任何优化来避免过度消化。这使得FabALACTICA成为一种有吸引力的酶,例如在还原和非还原条件下的LC-MS分析、抗体高阶结构(HOS)的结晶和NMR研究、双特异性或多特异性抗体的表征、单价结合研究和完整的Fc聚糖分析。浙江IgGZEROIdeS蛋白酶蛋白组学