实行合同能源管理的节能服务企业的内部管理人员，尤其是财务人员缺乏纳税筹划和涉税风险的意识比较淡薄，合同能源管理项目实施前未能进行合理的税收筹划，也没有将税收筹划活动贯穿于合同能源管理的全过程；在实施合同能源管理项目时没有落实涉税风险的控管措施。针对节能服务企业对享受企业所得税免税优惠中单独核算及分摊标准的疑惑，应区分不同的合同能源管理项目单独核算收入和支出；而对于公共费用部分，应明确按照资产、人员或者营业收入等标准进行分摊，增强核算的可操作性。节能服务公司要做大量的项目，就需要大量的投资和融资。正是由于多赢性，使得合同能源管理具有持续发展的潜力。普陀能源费用托管型合同能源管理
合同能源管理的合同签署后，节能服务公司提供项目设计、项目融资、原材料和设备采购、施工安装和调试、运行保养和维护、节能量测量与验证、人员培训、节能效果保证等全过程服务。在完成设备安装和调试后即进入试运行阶段，合同能源管理的节能服务公司还将负责培训用户的相关人员，以确保能够正确操作及保养、维护改造中所提供的先进的节能设备和系统。在合同期内，设备或系统的维修由合同能源管理的节能服务公司负责，并承担有关的费用。在根据合同所规定的费用全部支付完毕以后，合同能源管理的节能服务公司把项目交给用户，用户即拥有项目的所有权。合同能源管理商务模式业务流程以现金流量表为基础，分析用能单位的现金流。
尽管合同能源管理项目的实施已有不少成功案例，并且拥有广阔的发展前景，但依然存在许多制约因素，主要表现在：当前节能降耗还没有成为某些高耗能企业和地方部门的自觉意识，仍然有不少的企业为了一己私利，以经济利益为中心，节能降耗意识较弱。在法律制度方面还没有形成和确立节能投资激励机制和企业节能激励机制；缺乏具有一定强制性的政策法规，影响合同能源管理产业的发展。很多城市尚缺乏系统性的适合本地市场的财务管理、财税减免、金融支持、政策性奖励等法律法规。政策落实缺乏时效性。
合同能源管理项目的融资租赁在具体操作时很复杂，更多的风险点及模式有待于根据具体的合同能源管理项目模式进行防范及设计。目前，有一种能源管理模式，运用市场和技术经济手段达到节约使用能源的目的。有一类服务型机构叫节能服务公司，正在迅速发展。他们专门帮助用能单位进行节能管理，对用能大户进行节能诊断，他们可以投资进行技术改造，还可以帮助用户实现节能运行。只要用户与节能服务公司签订合同能源管理，用能单位无需投入和承担风险，而且与节能服务公司共同分享节能收益，这就是合同能源管理。减少用能成本支出，提高产品竞争力。
在目前的合同能源管理中，现行税收政策对节能服务企业享受税收优惠预设了比较苛刻的条件，从而导致现阶段可以享受税收优惠政策的企业比例是相当小的，税收优惠政策的杠杆效应没有充分显现。设备无偿转让收入问题存在争议由于合同能源管理在我国属于新兴产业，相关税收政策也比较笼统，在许多方面的规定还不尽完善，在实施中存在较大争议。如节能服务企业为客户提供合同能源管理服务时，其中也包括通过面向全社会的采购，为客户优良节能设备。合同合同能源管理是节能服务公司与用能企业之间签订的节能减排服务合同。合同能源管理的实质就是以减少的能源费用来支付节能项目全部成本的节能业务方式。上海合同能源管理模式如何收费
合同能源管理为降低支付风险，用户可向节能服务公司提供多方面的节能效益支付保证。普陀能源费用托管型合同能源管理
合同能源管理的服务包括：为企业节能改造提供诊断、设计、融资、改造、运行、管理一条龙服务。既可为客户选择提供先进、成熟的节能技术和设备；也可为客户的节能项目提供资金，确保客户项目的工程质量。能源合同管理在实施节能项目的企业(用户)与节能服务公司之间签订，合同能源管理节约的能源费用来支付节能项目的全部成本；用户规避了节能项目的资金风险、质量风险、安全风险，节能服务公司以财产押抵来确保项目节能效益的承诺；客户项目的长期节能效益成为节能服务公司的法定责任。用户用浪费的能源，转化为"零投资"的新技术设备；用浪费的能源，来投资节能改造；节能服务公司用新技术设备来换取用户浪费的能源，化废为宝，点石成金，实现多赢。普陀能源费用托管型合同能源管理
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