METTL3能够促进肺腺细胞的生长、生存和侵袭，但还不清楚它是否作为m6A调节器或效应器发挥作用[25]。在急性髓细胞白血病（AML）患者中，m(6)A调控基因的突变或拷贝数变化与TP53突变存在密切联系，且m(6)A调控基因的改变与AML不良预相关[26]。此外，FTO在AML中高表达，它通过降低mRNA转录本中的m(6)水平，调节ASB2和RARA等靶点的表达，增强了白血病基因介导的细胞转化和白血病形成，并抑制全反式维甲酸(ATRA)诱导的AML细胞分化[27]。在脂肪形成过程中，FTO表达与m6A水平成负相关，促进脂肪形成[3]。在胶质细胞瘤样细胞中，ALKBH5通过lncRNAFOXM...

我们知道WB实验步骤繁琐，一次实验历时也不短，从提蛋白到显影结束可能要三天，我们就讲一下这里面的一些关键环节。一、蛋白提取及变性1、提取蛋白很多经验丰富的WB实验者都深有体会，蛋白提取是影响结重要的环节之一。该过程重要的是防降解和保证蛋白浓度不要太低。防降解主要有两点，一是裂解前注意保持样品处于低温环境中，二是裂解时加入足够的蛋白酶抑制剂。我们习惯先用冰冷的PBS做心脏的体循环灌注，然后冰上取脑，分离各脑区(嗅球，皮层，海马，中脑，小脑，延髓，丘脑，纹状体)后置于，用液氮速冻后转移至-80度冰箱长期保存。接着是保证蛋白浓度，即要加入适量的裂解液，加太少会使蛋白提取不充分，加太多会让蛋白浓度太低...

2）固定的目的①保持其原有状态：使细胞内的蛋白质、脂肪、糖、酶等成分转变为不溶性物质，迅速防止、细胞的死后变化，防止自溶与，防止细胞过度收缩或膨胀而失去其原有形态结构，使之尽量保持生前的状态和结构。②以便染色后易于鉴别和观察：不同成分对染料有不同的亲和力，以便染色后易于鉴别和观察。③使块硬化，便于制作薄片（块在脱水、包埋、切片、染色等过程中不易损坏）。（3）固定液固定液种类：一类是单纯固定液，即只有一种试剂；另一类是混合固定液，由两种或两种以上试剂组成。作为较好的固定液，应有下列特性，首先，有强渗透力，能迅速的渗入内部；其次，不使过度收缩或膨胀，并能使内欲观察的成分得以凝固为不溶性物质；能使达...

m6A修饰图谱构建及作用机制：通过m6A甲基化测序（MeRIP-Seq,miCLIP）构建疾病细胞模型或者发病组织的m6A修饰谱，分析m6A的motif,peaks数量及分布，Peak关联基因的特征，联合RNA-seq研究m6A甲基化与表达的关系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)为研究ALKBH5的m6A作用机制，作者利用芯片和m6A-seq筛选到胶质瘤增殖相关的FOXM1，通过qPCR、WB、免疫荧光、核质分离WB/qPCR、RIP和MeRIP等实验证明ALKBH5通过去甲基化调节FOXM1在GSCs中的表达。为研究ALKBH5对FOXM1的作用是否受其他因子的调节，作者研...

建议按照2×106每孔的数量将293T细胞均匀铺入。(2)第二天：在24小时之内，观察293T细胞的汇合度在90%~95%之间时，向其中加入DNA-脂质体复合体，DNA-脂质体复合体制备方法如下：a)轻轻混匀LipoMax，根据说明书加入相应量于500µlOpti-MEM无血清培养基中，混合均匀并置于室温5分钟。b)在500µlOpti-MEM无血清培养基中稀释DNA，总质量为15µg按照载体质粒:psPAX2:=4:3:1的比例加入DNA。c)将稀释后的LipoMax和稀释后的DNA轻轻混匀，常温静置20分钟，形成DNA-LipoMax复合体。(3)将DNA-LipoMax复合体轻柔地滴加至...

一种是用beta巯基乙醇打开蛋白质分子二硫键的，另一种是用DTT(二硫苏糖醇)。两者的作用是一样的，但特点不一样，前者更容易与氧气反应，稳定性比后者差，如果在常温下暴露在空中，前者只能维持24小时的活性，后者却可以维持7天左右。所以该如何选择?如果是蛋白样品较少，跑几次就可以用完的样品，这时选择beta巯基乙醇。如果样品很多，计划跑上几十次的，优先选择DTT,建议变性后分装保存。二、SDS-PAGE凝胶配制1、配胶前准备首先强调一下，一块好的胶是跑好蛋白的前提，所以这个环节也不容忽视。玻璃板的选择，一种是1毫米厚度的，另一种是，这个厚度选择也是有讲究的，如果上样体积小于10微升，优先选1毫米，...

转录组测序结果及TCGA数据库分析）图5RNA-Seq和m6A-seq联合鉴定SOCS2是介导的m6A修饰的下游靶基因PLoSOne2015,在许多不同种类的RNA中，都已观察到N6-腺苷(m6A)的甲基化，但其在microRNAs中还没有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3细胞系中，通过敲除m6A甲基转移酶FTO筛选到表达差异的microRNA,说明miRNA受m6A甲基化的调控。进一步通过MeRIP-Seq发现相当一部分的microRNA具有m6A修饰。通过motif分析，他们发现了区分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。该文章所述的表观遗传修饰在基因表达的转录...

必须仔细考虑所有可能影响实验的条件和技术参数以获得可重复且一致的实验结果。因此，要求实验人员深入了解和熟练掌握操作过程才能准确地构建CLP模型。造模评价该模型通过模型动物自身引发脓毒症，与临床脓毒症类似的地方在于有连续分散的细菌源，血中内检出率及细菌培养阳性率高，动物体温降低以及血流动力学早期高排低阻晚期低排低阻的特征也与临床相仿，在建模的同时模拟临床脓毒症方法，辅以充分的液体复苏和适当辅助(如药物)，另外这个模型可控性高，标准化水平高。该模型中脓毒症的严重程度受3个重要因素的影响：结扎盲肠的长度、穿孔针的大小和CLP后的支持。结扎盲肠的长度是死亡率的主要决定因素，随着结扎盲肠的长度的增加，促...

静置25分钟后把酒精倒干，用吸水纸吸出多余的酒精，然后配压缩胶，同样的操作，关键是梳子要插得快，要小心梳子下产生气泡，然后静置30分钟。如果是当天跑胶，我会等上层胶凝2个小时再用，但要注意防干燥缩水，可以在一个小时的时候沿着梳子上缘加点电泳液。所以我一般提前一晚制胶，泡于纯水或者电泳液里置于4度冰箱暂存。三、蛋白电泳1、上样前准备把胶组装到电泳芯上，注意密闭性(否则漏液)，如果内槽漏液就不是匀强电场了，条带可能就不是一条直线。然后内槽倒满电泳液，拔梳子，这一步要小心，梳子要两边一起缓缓往上拔出，然后观察泳道内有无脱落的胶粒或者胶丝，有的话用1毫升注射器吸出。然后从冰箱取出蛋白样品，解冻。准备振...

建立疾病模型的目的是为了防治人类疾病。因此，疾病模型研究结果的可靠程度取决于模型与人类疾病的相似或可比拟的程度。接下来就让上海研录带您了解相关知识。一个好的疾病模型应具有以下特点：①能够再现所要研究的人类疾病，动物疾病表现应该与人类疾病相似；②动物能重复产生该疾病，尽可能能在两种动物体内复制该病；③动物背景资料完整，实验动物合格，生命周期要满足实验需要;④动物要价廉、来源充足、便于运送；⑤尽可能选用小动物。生物医学科研专业设计中常要考虑如何建立动物模型的问题，因为很多阐明疾病及疗效机制的实验不可能或不应该在患者身上进行。常要依赖于复制动物模型，但一定要进行周密设计，设计时要遵循下列一些原则：(...

RNA各种可逆的化学修饰被认为是一种新的表观遗传调控方式。m6A是真核生物mRNA常见的化学修饰，在调控mRNA稳定性，剪切和翻译方面具有重要的作用。作者使用转录组测序发现了METTL3（甲基转移酶3），一种主要的RNAN6-腺苷-甲基转移酶，在人肝细胞（HCC）和多种实体中高表达。在临床上，METTL3的过度表达与肝细胞患者不良预有关。体外实验证明敲除METTL3会抑制HCC细胞增殖，迁移及克隆形成。体内实验证明敲除METTL3会明显抑制HCC体内成瘤和肺转移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系统，内源性高表达METTL3会促进HCC细胞在体外和体内生长。通过转录组测序、m6A-...

是整体甲基化进程所必须的[2]。FTO是ALKB家族的成员，作为个被发现的去甲基酶，可影响剪切因子SRSF2的RNA结合能力，进而调控pre-mRNA的剪切加工过程[3]。目前已发现FTO调节异常与肥胖、大脑畸形和生长迟缓相关，揭示m6A可能对这些疾病具有重要的调节功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被发现具有去甲基作用的另一个成员，以RNaseA敏感的方式与核小斑共定位，它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外，ALKBH5和它的去甲基化活性影响新生mRNA合的成和剪切效率[7]，且ALKBH5敲除雄性小鼠表现出精子发生异常，这可能是精子发生相关...

|基因组DNA扩增|RNA扩增|克隆与表达克隆基因|克隆试剂盒|克隆筛选|感受态细胞|突变转染|转化|体外转录/翻译|其它表达分析Northern印迹分析|分支DNA和mRNA定量|差别基因表达|反义寡核苷酸|RACE试剂盒|SAGE试剂盒|其它抗体蛋白A,GPLUS|抑制/凋亡抗体|信号分子抗体结构蛋白抗体|磷酸化特异抗体|融合蛋白tag抗体非哺乳动物蛋白抗体|细胞周期蛋白抗体|转录调节蛋白抗体|抗体制备佐剂|抗体片段|抗体同种型|抗体纯化|抗体制备试剂盒|其它第二抗体westernblot二抗|免疫组化二抗|其它试剂盒ELISA试剂盒|免疫组化试剂盒|放射免疫试剂盒|westernblot...

转录组和m6A分析显示精子发生相关基因的表达和选择性剪接发生了改变[19]。YTHDC2可促进靶基因的翻译效率，并降低其mRNA的丰度，在精子发生过程中起关键作用。当减数分裂开始时YTHDC2表达上调，YTHDC2敲除小鼠的生殖细胞没有经过偶线期的发育导致小鼠不育[20]。在DNA损伤反应中，METTL3可促进DNA聚合酶κ（Polκ）与核酸剪切修复途径快速定位到UV引起的DNA损伤位点，当缺失METTL3时，细胞无法迅速修复UV照射引起的突变，并且对UV照射更加敏感[25]。在淋巴细胞性小鼠过继转移模型中，Mettl3缺陷通过影响mRNAm6A修饰，降低SOCS家族mRNA衰减，增加mRNA...

1.首要原则：细胞不重要情况下立即丢弃，培养箱灭菌，所用培养基也都要丢弃，器械等重新灭菌或拆用新的。2.细菌污染一般都救不回来了，发现的时候培养基一般都很浑浊且细胞都死了3.污染且细胞很重要时：遇到念球菌污染，且细胞为基因改造细胞，非常重要。如231贴壁乳腺细胞，发现细胞周围出现很小的串珠透亮圆点，非常像念球菌污染，此时细胞状态尚可，且污染少。处理如下：用预热或室温PBS清洗3次，可适当振摇，将污染冲洗下来。随后加入10-20%双抗到培养瓶，置于37度培养箱1h，之后再用PBS清洗三遍，直至视野下无可见污染。此时细胞也被冲下大部分，因此此方法只适用在细胞贴壁强，状态好，密度高时使用。之后每天再...

实验样本分类实验一般采取样本有：血液样本、样本和细胞样本。通常，样本采集后，应立即用等渗溶液（PBS或生理盐水）尽量把血液漂洗干净（除非血液也是分析对象），用滤纸或纱布吸干，把样本分切成几分，每份的体积约2个黄豆大小，每份用一个管子装。血液样本的采集应根据不同实验的要求，将会采取不同策略。血清样本：全血中不加抗凝剂，血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黄色透明液体。（全血标本室温放置2小时3000rpm/min离心15min）血浆样本：全血中加抗凝剂，血液凝固后取出的含凝血因子的淡黄色透明液体。（可用EDTA或肝素作为抗凝剂，标本采集后30分钟内于2-8℃，3000rpm/min离心15min）如...

小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴，引起轻微的血管扩张；用无菌手术刀、刀片或锋利的剪刀，快速截断小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次，之后每次需截除2-3毫米；从尾部像尾尖方向按摩，增加血流；用采集血液；结束后，按压伤口或使用止血剂来止血；每次量大约可达。小鼠眼球取血单手保定好小鼠；必要时剪掉小鼠胡须，防止污染血液；轻压取血侧眼部皮肤，使眼球充血突出；用弯头镊夹取眼球并快速在摘取；同时用左手中指轻按小鼠心脏部位，以加快心脏泵血速度；当血液流尽时，用脱臼法处死小鼠；大鼠眼眶取血先将小鼠进行麻醉，大鼠翻正反射消失时不在继续麻醉；抗凝处理过的玻璃毛细采样管，掰成2-3厘米长度；右手食指和拇指轻按眼眶两侧皮肤，使眼球...

如胰腺，一般取胰岛较多的胰腺尾部；肺应取有细支气管及带有软骨片的小支气管部。如果实验需进行多样本的采集，采集顺序应按照：消化，神经系统，皮肤，肌肉等的顺序进行。选好块的切面。熟悉某些成分安排，然后决定其切面的走向；如一长管状以横切面较好。切除不需要的部分。特别是周围的脂肪等，应尽可能掉，否则给固定、脱水、浸蜡、切片等带来一些不必要的问题。样品的固定（1）固定的方法：①小块固定法：从动物取下的小块，立即置入液态固定剂（这是应用经常的方法）。②注射/灌注固定法：某些块由于体积过大或固定液极难渗入内部或需要对整个脏器或整个动物进行固定，这时宜采用注射固定法，将固定液注入血管，经血管分支到达整个和全身...

RNA甲基化修饰（m6A）研究RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m6A）是高等生物mRNA和lncRNAs上为普遍的修饰。目前发现microRNA，circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有发生m6A修饰。m6A修饰主要发生在RRACH序列中的腺嘌呤上，其功能由“编码器(Writer)”、“消码器(Eraser)”和“读码器(Reader)”决定[1]。“编码器(Writer)”即甲基转移酶，目前已知这个复合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429；而ALKBH5和FTO作为去甲基酶（...

原代细胞是指在机体或组织中直接从生物体分离出来的、未经传代培养的细胞。这种细胞保持着其原始的生物学特性，具有高度的活性和分裂能力。原代细胞在许多生物医学研究中具有重要地位，包括药物筛选、疾病模型的建立以及疫苗研发等。原代细胞的获得通常是通过组织剪切、消化或酶解等方式从机体或组织中分离出来。这些细胞脱离了它们在生物体中的环境，但是仍然保持着其基本的生物学特性，包括细胞膜、细胞核、细胞器以及其他重要的生物分子。原代细胞在未经过传代培养的情况下，保持着其原始的生物学特性，因此，它们常常被用于药物筛选、毒理学研究等。同时，由于原代细胞具有高度活性和分裂能力，它们也被用于组织工程和再生医学中，如皮肤移植...

我们知道WB实验步骤繁琐，一次实验历时也不短，从提蛋白到显影结束可能要三天，我们就讲一下这里面的一些关键环节。一、蛋白提取及变性1、提取蛋白很多经验丰富的WB实验者都深有体会，蛋白提取是影响结重要的环节之一。该过程重要的是防降解和保证蛋白浓度不要太低。防降解主要有两点，一是裂解前注意保持样品处于低温环境中，二是裂解时加入足够的蛋白酶抑制剂。我们习惯先用冰冷的PBS做心脏的体循环灌注，然后冰上取脑，分离各脑区(嗅球，皮层，海马，中脑，小脑，延髓，丘脑，纹状体)后置于，用液氮速冻后转移至-80度冰箱长期保存。接着是保证蛋白浓度，即要加入适量的裂解液，加太少会使蛋白提取不充分，加太多会让蛋白浓度太低...

注意事项1.病毒包装的几个关键点主要包括：细胞因素、载体系统(尽量使用成熟的商业化载体系统)、构建重组的质粒正确与否、质粒抽提纯化情况、包装转染控制(24、48小时的细胞及荧光状态判断)、目的基因对病毒包装影响(基因大小、序列情况、蛋白功能毒性等都会影响到是否能包装成功)。，需要观察包装病毒后的48h培养基颜色是否橙红。3.病毒浓缩：病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想浓缩病毒的话，也可以直接将收集的病毒上清作为要的细胞的培养基，但是可能效果会不太好。并且一般收病毒时，培养基的营养已经损耗了很多，那样直接培养细胞会损害细胞，所以建议还是进行浓缩后再。常见问题1.包装病毒时293T细胞状态...

3）基因/蛋白质表达定性或定量检测在进行分子检测的过程中，保持核酸和蛋白质的完整性至关重要，因此在取样过程中，应尽量避免核酸及蛋白质的降解。如不注意采样过程，将会导致样本中的核酸及蛋白质的无差别降解，严重影响后续分子检测结果。在条件允许的情况下，样本在离体后应立刻装入冻存管内，并立即放入液氮中进行冷冻。在RNA提取样本的保存过程中，可以选择非冷冻型RNA保存液或Trizol试剂进行RNA酶的。针对蛋白质提取样本的保存，我们同样可以使用商品化的蛋白酶剂进行短期处理。聚合酶链式反应（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印迹（Westernblotting，WB），这两种实验手段...

这种细胞保持着其原始的生物学特性，具有高度的活性和分裂能力。原代细胞在许多生物医学研究中具有重要地位，包括药物筛选、疾病模型的建立以及疫苗研发等。原代细胞的获得通常是通过组织剪切、消化或酶解等方式从机体或组织中分离出来。这些细胞脱离了它们在生物体中的环境，但是仍然保持着其基本的生物学特性，包括细胞膜、细胞核、细胞器以及其他重要的生物分子。原代细胞在未经过传代培养的情况下，保持着其原始的生物学特性，因此，它们常常被用于药物筛选、毒理学研究等。同时，由于原代细胞具有高度活性和分裂能力，它们也被用于组织工程和再生医学中，如皮肤移植、骨头修复和神经再生等。此外，原代细胞模型在疾病研究中也扮演着重要角色...

转录组和m6A分析显示精子发生相关基因的表达和选择性剪接发生了改变[19]。YTHDC2可促进靶基因的翻译效率，并降低其mRNA的丰度，在精子发生过程中起关键作用。当减数分裂开始时YTHDC2表达上调，YTHDC2敲除小鼠的生殖细胞没有经过偶线期的发育导致小鼠不育[20]。在DNA损伤反应中，METTL3可促进DNA聚合酶κ（Polκ）与核酸剪切修复途径快速定位到UV引起的DNA损伤位点，当缺失METTL3时，细胞无法迅速修复UV照射引起的突变，并且对UV照射更加敏感[25]。在淋巴细胞性小鼠过继转移模型中，Mettl3缺陷通过影响mRNAm6A修饰，降低SOCS家族mRNA衰减，增加mRNA...

痉挛型脑性瘫痪(SCP)大鼠模型【简介】痉挛性脑瘫指发育异常引起的运动和感觉功能落后，造成肢体肌张力增高、腱反射亢进等一系列综合征。本实验利用脑立体定位解剖图谱,对大鼠的锥体束部位进行精确的立体定位,通过微量注射器对大脑锥体束所在部位注射无水乙醇造成锥体束坏死,的模拟了痉挛型脑瘫的解剖学及病理改变,术后大鼠产生明显的屈曲痉挛症状,且屈肌肌张力增高,症状和体持续时间较长,稳定性良好。从而建立一种可复制性良好且痉挛持续时间较长的稳定的大鼠痉挛型脑瘫动物模型,为进一步深入的探究痉挛型脑瘫的基础研究和临床诊治打下基础【目的】痉挛型脑性瘫痪(SCP)大鼠模型建立【动物】SPF级SD大鼠，雄性，周龄6~8...

首先，预实验必须要当做正式实验来对待（态度要放端正，这是必须的）。预实验的每一步都需要详细规划，多方筹谋。不论是实验动物的选择，还是检测试剂的购买，都尽量和正式实验统一标准。建议大家先把所有试剂和购买完毕后，再去购买实验动物。因为动物会长胖，长胖后给剂量就要增加，不仅多花钱，并且还容易影响实验效果。笔者曾经提前将实验动物买回，但因为特殊原因没能购买到造模，终只能忍痛割爱将动物赠送他人，白白亏了一笔血汗钱（那批老鼠在我这儿白吃白喝长得太胖，没办法用作造模）。动物及试剂购买首先需要考虑：实验动物品种、体重、性别、周龄（通常根据既往文献报道可以获得答案）、数量（需要考虑到实验有一定动物死亡率或者动物...

小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴，引起轻微的血管扩张；用无菌手术刀、刀片或锋利的剪刀，快速截断小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次，之后每次需截除2-3毫米；从尾部像尾尖方向按摩，增加血流；用采集血液；结束后，按压伤口或使用止血剂来止血；每次量大约可达。小鼠眼球取血单手保定好小鼠；必要时剪掉小鼠胡须，防止污染血液；轻压取血侧眼部皮肤，使眼球充血突出；用弯头镊夹取眼球并快速在摘取；同时用左手中指轻按小鼠心脏部位，以加快心脏泵血速度；当血液流尽时，用脱臼法处死小鼠；大鼠眼眶取血先将小鼠进行麻醉，大鼠翻正反射消失时不在继续麻醉；抗凝处理过的玻璃毛细采样管，掰成2-3厘米长度；右手食指和拇指轻按眼眶两侧皮肤，使眼球...

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把膜先用TBST泡洗两遍再用5%脱脂奶粉或者BSA室温封闭1-2小时。注意一定要让蛋白面充分接触封闭液。2、孵一抗脱脂奶粉封闭的话，要用TBST泡洗三遍再转移至一抗溶液中，BSA封闭的可以直接转移至一抗中。如果膜的宽(膜是一个长方形，这里的宽与长相对应)不大于8毫米，我习惯置于15毫升离心管中孵育，两条膜"背对背"式放置于一个管子里(3毫升液体即可)。如果大于8毫米，就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度过夜，一般是12-18个小时，注意放置水平，用摇床。内参等蛋白丰度很高的如果孵久了可能出现条带连在一起的情况，这时可以缩短孵育时间或者降低一抗的浓度。六、孵二抗显影1、孵二抗室温一个小...