生物菌肥对阳光中的紫外线十分敏感。存放或使用时尽量避免强光直接照射，因此生产上一般不采用地表撒施，可以在阴天或清晨、傍晚于土壤中施用。喷雾时只要在植物的叶片背面均匀喷布即可。混合使用：生物菌肥可以单独施用，但是不能完全代替化肥或有机肥，事实是与后两者混合使用的效果要好于它们的单独使用。要谨慎不要将菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥(如硫酸钾等)以及草木灰混合用，因为这些药、肥，很容易杀死生物菌。或者先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。还应防止与未腐熟的农家肥混合施用。施用时期：要注重生物菌肥不是***肥，一般做底肥，如果追施，在作物的营养临界期和营养大量吸收期前一周施用，效果好。而在蔬菜等经济作物上，微生物菌剂应采用蘸根、灌根的方式进行集中施用，微生物菌剂的施用量不能过大。因为生物菌肥施入土壤后有一个菌群繁殖、壮大的过程。因此，要先于作物需肥期10-15天施用，此后生物菌肥可以长期、均匀、持续地供给作物养分。生物菌肥中的菌种能够分解有机物质，改善土壤结构，增加通气性和保水性，提高土壤肥力，减少土壤侵蚀。山西本地生物菌肥技术指导
不注重菌的种类，认为一种菌可以解决多种问题。超过保质期使用就没有效果国家标准规定，“农用微生物菌剂产品”及“有机物料腐熟剂产品”液体制品保质期为3个月，粉剂及颗粒制品为6个月。超过保质期并不意味着产品没有效果，要区别对待。少数用户缺乏对症用菌的意识，选购产品时只注重是否含菌，而不关注菌的种类，使用不对症的菌品种后，达不到所需目的。现阶段在农业部获得登记的微生物品种有9种，具有不同的功能，要结合需求、菌种特点、菌种功能选用对症的产品。山东湿地生物菌肥价格实惠一种看法认为它肥效很高，把它当成肥料，甚至扬言可以完全取代化肥；
玉米上用微生物菌肥效果特别好，因为它不仅能可做基肥也可做追肥，具体用法是：1.基肥：每亩施用有机肥3000千克施肥方法可以采用沟施或穴施方法，同时根据土壤性质配合适量的氮肥、磷肥。2.追肥：每亩施肥量低于20千克标准氮肥时，宜在拔节中期一次追肥杆穗齐攻。一般早熟品种播后30天左右，即"喇叭口期"，追肥为好。中熟品播种后25天左右，追肥为好。晚熟品种播后35--4天追肥为好。每亩施用量超过20千克标准氮肥的，以分次追肥为好。重点放在攻杆和攻穗肥。各地一般采用二次追肥，一般以前重后轻，即攻杆肥占60%--70%为好，攻穗肥占30%---40%为好，在拔节、孕穗期喷施微量锌和硼。
由于微生物菌肥中含有大量的有益菌，菌肥施入土壤后，有益微生物迅速在土壤中以几何级数繁衍扩散，以及功能微生物的代谢产物，固氮解磷解钾，能改善土壤的理化性状，土壤板结，维持营养平衡，减少养分流失，金宝贝菌肥中还含有腐殖酸、有机质和多种微量元素，可刺激作物玉米生长发育，增强玉米抗病抗旱抗寒能力，还具增强抗逆，抗倒伏等作用，同时对农药残留毒性分解也有一定作用，还可提高化肥利用率，明显降低成本，菌肥可替代30%左右的化肥，每亩地直接节省500～800元，每亩可增产200斤以上。因此，微生物菌剂与有机肥搭配施用，可将肥效达到1+1＞2的效果。
靠见效速度评价产品好坏，认为见效快的就是好菌剂或菌肥肥料效果的发挥与微生物菌群繁殖速度、菌群数量关系紧密，菌群生长存在周期，这是与化学肥料和植物调节剂的比较大区别，也就出现了微生物肥料***性不如后两者的现象。见效慢并不意味着品种是无效果的，能在较短时间内看到作物长势明显改善的品种未必是好品种，其中也不乏一些添加了植物调节剂的品种。使用生物菌肥一定要投入有机肥。如果没有有机肥纯使用生物菌效果也不好，生物菌需要一定的，有机质进行分解，进行繁殖，生物菌有粮食，它吃饭才进行繁殖，多施点有机肥才能繁殖，长得比较好。微生物肥料具有解磷、解钾、固氮的作用，促进土壤中微量元素的释放及螯合，可提高肥料利用率10％～30％。四川本地生物菌肥价格实惠
80%以上的果园都在施用无机化肥，土壤板结透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等。山西本地生物菌肥技术指导
综上所述，从官方发布的标准里，我们看到《农用微生物菌剂GB20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求，是比执行《生物有机肥NY884-2012》类的要求高得多，如果是用普通生物有机肥料NY884-2012来冒充生物菌肥GB20287-2006标准，你可以举报它了。如果你买的产品是“生物有机肥”，而执行“农用微生物菌剂”的国家标准，等于是该产品的技术参数提高了10倍；同时，它的原料必须经过高温灭菌才能保证杂菌率达标（一般的有机质中杂菌含量都超标）。这些都大幅度增加它的成本，好多厂家并没有按要求来做，所以提醒各位老乡，价格和价值往往是成正比的，千万不要贪小便宜，吃大亏，用生物菌肥的钱买了普通的生物有机肥料。山西本地生物菌肥技术指导