首先，要选择正规厂家的产品。具备农业部微生物肥料登记证，包括：微生物菌剂登记证、生物有机肥登记证，或复合微生物肥料登记证；其次，要核对执行标准。农用微生物菌剂执行的是国家标准，为GB20287-2006，生物有机肥和复合微生物肥执行的是行业标准，分别为NY884---2012和NY/T798-2015；再次，要查看包装袋上菌数的标注。菌剂中的有效活菌数液体含量要≥2亿/克颗粒的要≥1亿/克，生物有机肥和复合微生物肥中的有效活菌数含量要≥2000万/克。在满足以上3个条件的情况下，用户可以根据所需要的功能选择含有特定功能菌种的微生物菌肥。菌肥的质量要看其所含“有效活菌”的数量，活菌越多效果约好，特别说明要是活菌！生物菌肥能够提供丰富的养分，减少对化学肥料的依赖，降低农业生产成本，同时减少化肥对环境的污染。云南多功能生物菌肥
误区2：种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。误区3：认为一种产品中菌的种类越多、菌种数量越大越好复合菌剂的使用效果会受到不同菌种生长习性的影响，盲目的复合，极易造成菌种间的拮抗，影响效果发挥。产品使用后起作用的只有活菌，因此菌衡量的标准为“有效活菌数（CFU）”，有效活菌数量越大效果越好。此外，菌的纯度也至关重要，当产品中霉菌杂菌数及杂菌率超标时也会影响应用。市场上少数不合格产品中含有致病菌，不仅修复不了土壤，还会导致病害发生。云南多功能生物菌肥造粒后再加菌、加菌后不经过高温进行物理造粒，是可行的、成熟的工艺，不存在颗粒状微生物菌剂是假的。
留心观察的果农朋友会发现在生物菌肥或者生物菌剂的外包装袋上，都有标有“XX亿活菌”或者“XX亿孢子”的字样。虽然说活菌跟孢子都是活的，但是这里面大有文章！首先，与真正意义上的活菌不同，孢子其实只是菌类的“种子”。它在干燥的包装袋里时，是处于休眠状态的。如果我们把它倒出来以后随便往田里一撒，那么它是***发挥不了作用的，这跟浪费钱没什么区别。一般来说，只有吸收了足够多的水分以及处于适宜的温度环境下，孢子才能打破休眠，重新***，使菌丝萌发出来，从而发生作用。
温度在微生物肥料中的作用这里就主要说温度与生物菌活性的影响。首先就结论上来说：生物菌的活性会随着温度降低而降低，但是生物菌不会被冻死，只会休眠。但不是说活性会随着温度降低而降低吗？怎么当前还更适合施用菌肥呢？别急，之所以有这些疑惑，是因为混淆了气温与地温的关系。1、气温我们平常所说的温度，无论是天气热了，还是天气凉了，其实一般都是指的是气温。而气温的测量是在离地1.5米，避免阳光直射、通风的草坪上，这样能更真实体现大气的温度状况。但是我们的菌肥是用在土壤当中的，所以气温的变化不能用来作为衡量生物菌活性的标准，为此我们需要的是地温的衡量。我们致力于为广大农业生产者提供高质量的产品和服务，共同推动农业可持续发展。
5.微生物肥料不论是做基肥，还是追肥，都不能暴露在土壤表面。由于阳光照射，使微生物的活性下降。6.注意生产日期，放置时间过长的微生物肥料中的微生物的活性下降。7.冬春季保护地中的地温低，低温微生物的生长繁殖变慢、活性下降。应提高地温，用秸秆覆盖，有利于提高地温，增强微生物活性的作用。微生物菌肥有明显减少蔬菜体内硝酸盐，亚硝酸盐和重金属含量，提高化肥利用率以及培肥土壤等作用，我们应做好微生物菌肥的合理化施用。微生物被残留的除草剂物质杀害，土壤中没有足够微生物使菌肥发酵繁衍而形成有效的菌群，阻碍了肥效的发挥。云南多功能生物菌肥
于各种常用化肥·有机肥配合使用，提高肥料的利用率，增产增收效果***。云南多功能生物菌肥
选择质量合格，过期不能用。[1]菌肥必须保存在低温（适温度4～10℃）、阴凉、通风、避光处，以免失效。有的菌种需要特定的温度范围，如哈茨木霉菌需要保存在2-8℃的恒温箱内，有效期为一年，而一些芽孢杆菌要根据生产质量高低，主要是看芽孢化水平，芽孢化高的能保存一年半甚至更久，芽孢化不好的达不到半年就失效，所以菜农应谨慎选择菌肥产品。二、根据菌种特性，选择使用方法。建议大家在使用生物菌肥的时候，基施可用方法有：撒施、沟施、穴施，也可以撒施一部分，剩余部分可以穴施效果更佳。不建议冲施生物菌肥，这样效果不佳，但是可以灌根，主要针对液体生物菌肥。三、尽量减少微生物死亡。施用过程中应避免阳光直射；蘸根时加水要适量，使根系完全吸附。蘸根后要及时定植、覆土，且不可与农药、化肥混合施用，特别是现在很多菜农为防治根茎部病害，使用农药灌根，如多菌灵、恶霉灵、硫酸铜等药剂，***、细菌都能防治，但对菌肥中的有益菌也有杀灭作用，所以建议使用菌肥后不要再用农药灌根。云南多功能生物菌肥