选择质量合格，过期不能用。菌肥必须保存在低温（较适温度4～10℃）、阴凉、通风、避光处，以免失效。有的菌种需要特定的温度范围，如哈茨木霉菌需要保存在2-8℃的恒温箱内，有效期为一年，而一些芽孢杆菌要根据生产质量高低，主要是看芽孢化水平，芽孢化高的能保存一年半甚至更久，芽孢化不好的达不到半年就失效，所以菜农应谨慎选择菌肥产品。根据菌种特性，选择使用方法。建议大家在使用生物菌肥的时候，基施可用方法有：撒施、沟施、穴施，也可以撒施一部分，剩余部分可以穴施效果更佳。不建议冲施生物菌肥，这样效果不佳，但是可以灌根，主要针对液体生物菌肥。尽量减少微生物死亡。施用过程中应避免阳光直射；蘸根时加水要适量，使根系完全吸附。蘸根后要及时定植、覆土，且不可与农药、化肥混合施用，特别是现在很多菜农为防治根茎部病害，使用农药灌根，如多菌灵、恶霉灵、硫酸铜等药剂，***、细菌都能防治，但对菌肥中的有益菌也有杀灭作用，所以建议使用菌肥后不要再用农药灌根。微生物是土壤的重要组成部分并且是土壤生态系统的灵魂和中心，必将在土壤健康的恢复中发挥重要作用。陕西微生物菌剂
习惯与化学农药混用降低活性
微生物菌剂中含有活菌成分，将微生物菌剂与杀细菌药剂混合使用且长时间放置，极易影响菌的活性，造成部分菌死亡。
轻视使用量，用量不足，效果打折扣
使用微生物菌剂能取得好的效果，前提是要用足量。
土壤中的微生物种类繁多，数量巨大，接种的外来有益菌要形成优势菌群，需要经历来自环境的考验和土壤原有微生物的竞争，为了促进有益菌的繁殖需要人为创造有利于有益菌生长的条件，如改良酸化土壤，调整土壤酸碱度，增施有机肥，提高土壤物理肥力，增加微生物菌的数量等。
使用方法和时间掌握不当
微生物菌剂使用方式灵活多样，液体菌剂可以用来拌种、浸种、喷施、蘸根、灌根；固体菌剂可以用来拌种、蘸根、混播、混施。
正规微生物菌剂找哪家微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，是物质循环链上的重要环节！
随着科技的进步，微生物菌剂的效果越来越稳定，不但具有多种功效，促根、改土、抗重茬，而且对环境对人体友好。随着人类对品质生活要求的提升以及种植户认识的提高，微生物菌剂在农业生产上的应用也越来越多，未来也必将成为农业生产的主流必需品。
但现在仍有一些农户朋友抱怨，微生物菌剂应用效果不佳，这一方面是他们没有买到好的微生物产品，另一方面也可能是没有掌握微生物菌剂的正确使用方法。
那么微生物菌剂要如何正确使用呢？
由于微生物是活的生命，并且要有足够多的量才能发挥比较好的效果。因此我们要保证微生物菌剂能活着到达发挥作用的部位，并能迅速地增殖，产生足够多的数量以发挥功效。在考虑成本的情况下，土施的产品应尽量让微生物菌剂在根际，即根系及其周围的土壤中发挥效果，能获得更好的性价比。
定植穴施或沟施穴施为佳，均匀混拌麦麸、碎磨稻糠、豆粕等有机质，若少量添加玉米粉、黄豆粉尤佳（为避免豆粕等有机质烧苗，尽量使用腐熟过的，并添加晒干的泥土）。施入后及时覆土。微生物菌剂为什么穴施效果比较好？作物的生长离不开营养，而作物叶片光合作用供给的营养只占很少一部分，大部分的营养供给都是来自于作物的根系吸收。所以保证根系的生长及根系周围土壤环境健康是十分有必要的。只有保证了根系周围土壤环境营养丰富，有机质充足，就能保证根系很好地生长，为作物提供全生长周期的营养需求。混拌底肥、有机质旋耕进土下若刚开始使用微生物菌剂，建议加倍用量，旋耕下底肥时使用。这是为什么呢？因为长期使用化肥的土壤，比如连作三年以上的土壤，土壤营养平衡一般就会被打破，常年使用的就会发生一系列土壤问题，严重危害了作物的质量和产量。生物菌剂有什么作用?不说哪些虚的，直说“实际”的，在我看来，无外乎有这几点作用!
对植物根系：生根，养根、壮根。有益菌分泌物质刺激根系迅速生长，对根系有修复和再生的功能，减少沤根，烂根，促进根系发达，使植株健壮，叶片肥厚，叶色浓绿，花色鲜艳，提高植物成活率。提高肥料利用率：制造和协调农作物吸收营养。微生物菌剂里的有益微生物把土壤中植物不可溶的磷钾钙镁锌等释放游离出来供植物吸收，相当于在植物根系建立了营养库。产生的微量元素刺激根系生长，极大提高了肥料利用率。调节土壤，没有伤害：降解硝酸盐和农药残留，修复土壤，提高农产品品质。微生物的生命活动降低硝酸盐及农药残留，调节PH值，增加氨基酸、糖分、维生素等含量。微生物菌剂恰当使用可提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。微生物菌剂介绍
科学研究发现，没有有机质，就没有肥沃的土壤。有机质对农作物是极其重要的，是农作物的重要营养来源。陕西微生物菌剂
盲目购买应用强酸性肥料味精厂的下脚料生产的有机肥，该肥能吸引人们购买主要原因是颗粒光滑、均匀，气味芳香，内含氮：16%以上，有机质，氨基酸，因含氮高，作物应用后长势虚旺许多人因无知而感到用了好肥料，哪知已严重的加重了土壤的酸化程度。应用含有大量硫酸铵的化学肥料。因柱状化肥含水量大，如果氮肥用尿素做原料，柱状很快吸潮散开，而用硫酸铵吸潮后柱体变硬，不散碎。“尿素”属于中性肥料，适宜任何土壤。“硫酸铵”属酸性肥料，只适合中性或碱性土壤，所以，这类肥料土壤越用越酸化。个别农户还再使用“过磷酸钙”，该品是磷矿石+硫酸反应而成酸性土壤对作物的生长和微生物的活动产生了极为不利的影响，既降低肥料利用率(特别中微肥)，又降低了作物产量。并且造成土壤碱性钙离子的淋失，苦痘病发病重，还造成锰离子的解释、释放，锰中毒发生严重。陕西微生物菌剂
成都盖尔盖司生物科技有限公司成立于2006-06-14年，在此之前我们已在生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥行业中有了多年的生产和服务经验，深受经销商和客户的好评。我们从一个名不见经传的小公司，慢慢的适应了市场的需求，得到了越来越多的客户认可。公司主要经营生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥，公司与生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥行业内多家研究中心、机构保持合作关系，共同交流、探讨技术更新。通过科学管理、产品研发来提高公司竞争力。公司会针对不同客户的要求，不断研发和开发适合市场需求、客户需求的产品。公司产品应用领域广，实用性强，得到生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥客户支持和信赖。盖尔盖司,美大多,绿盛,通用,美洛迪,赛尔玛,美果菌秉承着诚信服务、产品求新的经营原则，对于员工素质有严格的把控和要求，为生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥行业用户提供完善的售前和售后服务。