化肥中不含有机质、腐殖质，因此大量使用化肥，土壤由于有机质和腐殖质的缺乏，土壤团粒结构遭到破坏，造成土壤板结，农植物产量下降。
化肥利用率低，氮肥因为易挥发、流失，利用率只有30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因为磷酸根化学活性活泼，施入土壤后大部分磷与土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等阳离子结合形成难溶性磷肥。钾的利用率也只有50%左右。
化肥大量使用使蔬菜瓜果品质**下降。由于作物不仅只需要氮磷钾，同时还需要钙铁锌硒等许多微量元素，而化肥一般成分比较单一，所以长期使用化肥必然导致土壤中所含养分趋于单一，易使作物营养失调，从而导致作物内部转化合成受阻，必然导致作物品质下降，瓜不甜，菜不香。
危害人体健康。大量施用化肥，易使蔬菜中硝酸盐含量超标，而亚硝酸盐与胺类物质结合形成N-亚硝酸基化合物为强致*物质。
化肥的大量使用，还造成土壤的有益菌、蚯蚓的大量死亡。
化肥的长期低效施用，往往造成土壤中某些元素的过分积累和土壤理化性质的变化及环境的污染。
从中国大量使用化肥看，越使用化肥，地力就越下降，就越依赖化肥，由此形成恶性循环。
微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，是物质循环链上的重要环节。中国澳门多功能生物菌肥市场报价
生物菌肥的概念：生物菌肥内含有特定的***微生物，通过其生命活动促进植物营养元素的供应量吸收，有的还能释放生长***并***有害微生物的形成。其作用机理有改善土壤的理化特性，提供植物所需的营养元素，改善植物对营养的吸收，使叶绿素含量增加，减少呼吸作用；微生物在正常的生长中释放***，刺激作物根系的生长，使作物积累营养成分，较终使产量提高；还可以增强植物抗逆性，细菌病虫害发生，降低产量损失。生物菌肥是不可多得的好肥料。宁夏功能性生物菌肥厂家供应国内外多年试验证明，用根瘤菌接种大豆、花生等豆科作物可提高共生固氮效能.
菌肥，简单说就是加了菌的肥料，专业称为微生物肥料。这可不是随便加的菌，而是由科研人员精挑细选的功能菌。一般来说，每种功能菌的作用都不相同。比如，有的功能菌能帮助果树的根吸收营养，有的能阻止危害果树的致病菌生长，有的能释放促进植物生长的物质等。菌肥作用：1、枯草芽孢杆菌：增加作物抗逆性、固氮。2、地衣芽孢杆菌：抗病、杀灭有害菌。3、解淀粉芽孢杆菌：分泌***物质，产生拮抗作用，营养与空间的竞争，诱导寄主产生抗性和促进植物生长，是菌肥中主要生防功能菌。
种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。80%以上的果园都在施用无机化肥，土壤板结透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等。
巨大芽孢杆菌：解磷促钾，提高植物对磷钾的吸收利用，促进肥效。胶冻样芽孢杆菌：解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素。侧孢芽孢杆菌：促根、杀菌及降解重金属。胶质芽孢杆菌：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力。泾阳链霉菌：具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力。棕色固氮菌：固定空气中的游离氮，增产。圆褐固氮菌：固氮、提高作物产量。放线菌：拮抗病原菌防病壮菌的作用，分泌细胞分裂素促进作物的生长。光合菌群：合成糖类、氨基酸类、维生素类、氮素化合物、抗病毒物质和生理活性物质等，是肥沃土壤和促进动植物生长的主力**。乳酸菌群：具有很强的杀菌能力，能有效***有害微生物的活动和有机物的急剧**分解，能够分解在常态下不易分解的木质素和纤维素，并使有机物发酵分解。乳酸菌还能够***连作障碍产生的致病菌增殖。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。中国澳门多功能生物菌肥市场报价
大量微生物菌群能活化土壤，增加土壤肥力、促进土壤形成良好的团粒结构，增加土壤的通透性。中国澳门多功能生物菌肥市场报价
注意棚温、地温和水温。施用菌肥的比较好温度是25～37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果较差。对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用。同时还应掌握固氮菌**适温度，土壤含水量是60～70%左右。因量制宜。对于多年来用化肥的田块施用了生物菌肥不能大量减施化肥和有机肥，因农作物对化肥产生了依赖性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子适应，因此，其取代量应做到***、二、三年分别取代30%、40%和60%。磷、钾肥只能补足，不能减少。因时制宜。生物菌肥不是***肥，所以，要在作物的营养临界期和大量吸收期前7～10天施用效果比较好。同时对不同作物或同一作物的不同时期，要选用不同的施用方法，作物叶背茸毛的多少、叶片蜡质的厚薄都会影响其使用效果。中国澳门多功能生物菌肥市场报价
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