拭子RNA提取试剂的选择?应有较高的提取得率。对离心柱法而言,拭子核酸得率的高低,主要取决于离心柱对核酸的吸附能力、洗脱能力以及裂解液的裂解消化能力。离心柱的硅胶膜RNA吸附性能好、裂解液细胞裂解能力强、洗脱液洗脱能力好,核酸的提取得率就高。反之,如果离心柱硅胶膜吸附能力不好,裂解液和洗脱液没有经过很好的优化,RNA的提取得率就不高。至于RNA提取得率的确定,我们可以使用紫外分光光度法,但是不能作为判断得率的单独标准,较好还是要做个PCR或荧光定量。β-巯基乙醇主要破坏RNase蛋白质中的二硫键。上海昆明RNA提取试剂
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RNA提取浓度不高或质量不佳原因及解决办法:1、得率过低:提取样本过低总量不足或者提取样本过多裂解不彻底;应当使用适当质量的组织或细胞进行提取,样本前处理一定要做好,裂解应充分。2、基因组残留:Trizol法提取时,分层后吸取上清时吸到中间层会带来严重的基因组污染;分层吸取时应当格外小心,不要吸取到中间层。如果是采用柱式法提取,可选择含有DNaseI的试剂盒进行提取,吸附在膜上的核酸直接用DNaseI进行消化,可极大限度的降低DNA残留。
酵母RNA的提取方法:浓盐法。酵母菌外层是厚达1.2µm的细胞壁,其化学成分是葡聚糖(30-40%)和甘露聚糖(30%),此外,脂类8.5-13.5%,蛋白质6-8%,还含有几丁质,酵母菌的葡聚糖,分子是为240000道尔顿,是一种分枝聚合物,葡聚糖与甘露糖之间由蛋白质维系起来。近10%的甘露聚糖的侧链通过磷酸二酯键与磷酸边接,所有这些连接方式都使得酵母提取物首要的也是关键的是如何破坏细胞壁。破壁方法有自溶破壁、酶法破壁等多种方法,而用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞的通透性,就可以使核酸从细胞内释放出来。由于RNA钠盐易溶于水,在含盐的菌体溶液中,RNA有较高的溶解度,这样,通过控制温度使蛋白质变性沉淀,通过离心将RNA及蛋白质和脱核酵母菌体分离,从而达到提取之目的。其中食盐起到自溶促进剂,以及防腐与脱臭的作用。mRNA是依据DNA序列转录而成的蛋白质合成模板。
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RNA 提取关键点病菌 RNA 在提取后也仍然具有传染性。上海昆明RNA提取试剂
动物细胞RNA提取:1、悬浮细胞:可直接离心后弃掉培养基,用无菌PBS清洗1~2遍后,再用适量PBS悬浮起来,然后再加入裂解液进行裂解。千万不要完全弃掉液体后,往沉淀细胞里直接加入裂解液,这样会使外表层的细胞裂解后释放的组蛋白包裹粘附在沉淀细胞外侧,从而限制沉淀内部的细胞与裂解液的接触,从而导致细胞裂解不彻底,降低RNA得率。2、半贴壁或贴壁不紧的细胞:弃掉培养基后,用PBS洗1~2次,然后直接吸取适量PBS用吸管或者泵吹打培养皿,把细胞吹下来,转移到无RNA酶的EP管中,加裂解液进行提取。3、贴壁细胞:需要先用胰酶消化,然后收集到无RNA酶的EP管中,离心去其上清,用PBS洗1~2次,去除多余的胰酶,以适量PBS重悬后继续进行提取步骤。上海昆明RNA提取试剂