NA基因扩增子测序及分析,研究菌群分布。参考文献2:·样本类型:***种子。·样本粉碎:每管20粒种子,电动组织研磨器配合研磨杵,研磨5min。·样本DNA提取:FastDNA Spin Kit for Soil提取。·下游实验:细菌16S rDNA基因扩增子测序及分析,研究菌群分布。 相关文献:1.Campisano A ,Antonielli L , Pancher M , et al. Bacterial Endophytic Communities in theGrapevine Depend on Pest Management【J】. Plos One, 2014, 9.2.Chen X , Krug L ,Yang H , et a土壤DNA提取保证正规产品——益启生物公司。浙江FastDNA SPIN土壤试剂盒土壤DNA提取代理价格
8000rpm离心1分钟,上清DNA溶液转移至新的离心管中。 2)PCR扩增及电泳 PCR扩增使用Identifiler Plus试剂盒,10 μl扩增体系中含4 μl master mix、2 μl primer set、4 μl模板,扩增程序为,95℃,11分钟;94℃,20 秒,59℃,3分钟,30个循环;60℃,10分钟;4℃保存;电泳在ABI 3500XL仪器中进行;电泳上样体系为,1 μl PCR产物,9 μl甲酰胺,其中已加Liz。 实施例2 以硅胶膜提取土壤尿液DNA 1)DNA提取 刮取含有尿液的表层土壤,烘干,取100-200 mg土壤样品,加入样品管中,然后加入400 ul土壤裂解液和20 ul 蛋白酶k,震荡混匀后,75℃加热裂解15分钟;最大转速离心5分钟,将上清液转移至新的样品管中,加入800 ul结合液,混匀;混合液转移至装有硅胶膜的离心柱中,12000rpm离心1分钟;倒弃收集管中废液,加入500 ul漂洗液,12000rpm离心1分钟;倒弃收集管中废液,加入500 ul漂洗液,12000rpm离心1分钟;倒弃收集管中废液,12000rpm离心3分钟,将离心柱转移至新的离心管中,70℃加热3分钟;加入20 ul洗脱液,70℃加热3分钟;12000rpm离心1分钟,丢弃离心柱,离心管中液体即为DNA溶液。 2)浙江FastDNA SPIN土壤试剂盒土壤DNA提取代理价格上海益启生物的联系电话。
(a)土壤裂解液,其组成成分包括表面活性剂、螯合剂、pH缓冲剂; 所述表面活性剂为:十二烷基硫酸钠、十二烷基磺酸钠、月桂酰基肌氨酸钠、聚乙二醇辛基苯基醚、TWEEN 20、TWEEN 40、TWEEN 60、TWEEN 80、NP 40、十六烷基三甲基溴化铵中的一种或两种及以上的混合,所述表面活性剂的质量浓度为1-100g/L,推荐的表面活性剂成分是十二烷基硫酸钠或十二烷基磺酸钠中的一种或两种的混合,推荐的表面活性剂质量浓度为1-10g/L; 所述螯合剂为乙二胺四乙酸二钠、乙二胺四乙酸三钾中的一种或两种,所述离液盐的浓度为1-100 mmol/L;
入RAase消化。问题7:A260/A230比值低怎么办?解决思路:·A230是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A230高表示样品中存在一些污染物。【1】蛋白去除不干净:增加蛋白沉淀离心的次数。【2】杂质去除不干净:洗脱之前,核酸吸附柱中尽可能不要残留液体,可增加空离心次数和时间。问题8:提取的DNA出现降解怎么办?解决思路:·优化裂解条件,避免过度裂解,降低物理破碎的力度·操作过程中是否有污染DAase,造成DNA降解上海益启生物卖的土壤DNA提取是正规产品吗?
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.53+0.03;1.09+0.03、1.51+0.05;1.37士0.03、1.43+0.03;0.81+0.02。提取不同土壤基因组DNA结果,有机营养土上样3μL其余土壤上样8μL;M: 1kb plus DNA ladder,Lane 1-4:自动化提取;Lane5-8:手工提取;Lane 1&5: 100mg有机营养土;Lane 2&6: 100mg花坛土;Lane 3&7: 250mg盐碱土;Lane 4&8: 250mg沙漠土。提取不同类型土壤DNA进行PCR及酶切结果。M: 1kb plus DNA ladder;Lane 1:有机营养土;Lane 2:花坛土;Lane 3:盐碱土;Lane 4浙江FastDNA SPIN土壤试剂盒土壤DNA提取代理价格
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