大肠杆菌的基因通常由4个字母的首字母缩写来命名,这些首字母缩略词源自它们的功能(已知时)并以斜体显示。例如,recA是根据它在同源重组中的作用加上字母A来命名的。功能相关基因被命名recB,recC,recD等等。蛋白质以大写首字母缩写命名,例如RecA、RecB等。当人类的基因组大肠杆菌测序完成后,所有基因在基因组中按其顺序编号(或多或少),并用b编号缩写,如b2819(=recD)。“b”的名字是由弗雷德·布拉特纳(FredBlattner)命名的,他领导了基因组测序工作。是用另一种大肠杆菌菌株W3110的序列引入的,该菌株在日本进行了测序,因此使用的编号以JW开头(JapaneseW3110),例如JW2787(=recD)。因此,recD=b2819=JW2787。然而,请注意,大多数数据库都有自己的编号系统,例如生态基因数据库将EG10826用于recD。然后,ECK编号专门用于大肠杆菌K-12MG1655菌株的等位基因。基因及其同义词的完整列表可以从数据库中获得,如EcoGene或Uniprot。随着科技的发展,诞生了不同制造工艺的大肠杆菌。气单胞菌属菌种
大肠杆菌生物学特征:1、理化特性。大肠杆菌是短杆菌,两端呈钝圆形,革兰阴性。有时因环境不同,个别菌体出现近似球杆状或长丝状。大肠杆菌多是单一或两个存在,但不会排列呈长链形状。大多数的大肠杆菌菌株具有荚膜或微荚膜结构,但是不能形成芽孢。多数大肠杆菌菌株生长有菌毛,其中一些菌毛是针对宿主及其他的一些组织或细胞具有黏附作用的宿主特异性菌毛。2、生化特性。大肠杆菌的生化代谢非常活跃。大肠杆菌可以发酵葡萄糖产酸、产气,个别菌株不产气,大肠杆菌还能发酵多种碳水化合物,也可以利用多种有机酸盐。大肠杆菌在常用的生化特性检测项目中,甲基红试验呈阳性,吲哚产生和乳糖发酵是阳性(个别菌株表现阴性),维-培试验是阴性,尿素酶和柠檬酸盐利用呈阴性(极个别菌株表现阳性),硝酸盐还原试验表现阳性,氧化酶表现阴性,氧化-发酵试验表现为F型[1]。日惹温泉链霉菌菌株金黄色葡萄球对大部分维生素的抗性得到了提高。
大肠杆菌顾名思义是一种直杆状、棒状的细菌,它大约长2微米,菌体直径大约0、25至1微米,算是一种中等大小的杆菌了。它同时还是一种兼性厌氧的细菌,也就是说当有氧气存在的时候它可以利用氧气进行呼吸氧化,而当没有氧气的时候它则进行无氧发酵,这一点十分有利于它在肠道这种复杂环境中进行生存。大肠杆菌对于营养的要求并不高,在我们实验室培养的时候,利用那种至普通的琼脂平板,在37度进行过夜的培养,就能生长出2-3毫米的灰白色菌落。当然,它在人类肠道中的繁殖会更慢一些。
大肠杆菌是种什么样的存在?大肠杆菌是一种很常见的细菌,革兰氏阴性,有鞭毛,能一运动,能耐受一定浓度的胆盐,菌体抗原能产生很好的保护性抗体,能在普通培养基中培养,对营养要求不苛刻,分离培养可用选择性培养基(EC培养基,伊红美兰培养基,麦康凯培养基等)。大多数大肠杆菌种类是非致病性的,少数种肉可引起人或动物肠道染上或菌毒血症,愈后良好。在病毒染上时非致病性大肠杆菌也可引起菌毒血症,是病毒病继发细菌染上的一种主要细菌。铜绿假单胞菌有菌体o抗原和鞭毛h抗原。
大肠杆菌在微生物学研究中经常被用作模式生物。栽培菌株(例如大肠杆菌K12)很好地适应了实验室环境,与野生型菌株不同,它们已经失去了在肠道中茁壮成长的能力。许多实验室菌株失去了形成生物膜的能力。这些特征保护野生型菌株免受抗体和其他化学攻击,但是需要大量的能量和物质资源。大肠杆菌在包括光催化在内的新型水处理和杀菌方法的研究中经常被用作表示性微生物。按照标准平板计数法,在连续稀释后,在琼脂凝胶平板上生长,可以评估已知体积处理水中活生物体或菌落形成单位(CFUs)的浓度,从而可以比较评估材料性能。金黄色葡萄球常寄生于人和动物的皮肤、鼻腔、咽喉、肠胃、痈、化脓疮口中。泗阳鞘氨醇杆菌菌株
枯草芽孢杆菌具有更强的营养物质竞争能力以及氧气竞争优势。气单胞菌属菌种
大肠杆菌包括大量的细菌群体,它们表现出高度的遗传和表型多样性。对大量分离的大肠杆菌和相关细菌进行基因组测序表明,需要对其进行分类重组。然而,这并没有做到,主要是因为它在医学上的重要性以及大肠杆菌仍然是至多样化的细菌物种之一:在一个典型的大肠杆菌基因组中,只有20%的基因在所有菌株之间共享。事实上,从进化的角度来看,志贺氏杆菌属的成员(痢疾志贺菌,福氏志贺菌,鲍氏志贺菌和宋内志贺菌)应该被归类为大肠杆菌菌株,这一现象被称为伪装的分类群。同样,大肠杆菌的其他菌株(如重组DNA工作中常用的K-12菌株)也有足够的不同,因此需要重新分类。气单胞菌属菌种
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